Applications de la spectrométrie de masse type MALDI-TOF à la bactériologie et à la distinction de variants génétiques
Langue Français
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Modalités de diffusion de la thèse :
  • Thèse confidentielle jusqu'au 05/09/2013.
  • Thèse soumise à l'embargo de l'auteur jusqu'au 01/09/2013 (communication intranet).
 
Auteur : Moussaoui, Louardi
Date de soutenance : 05-09-2012

Directeur(s) de thèse : Prévost, Gilles - Riegel, Philippe

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Physiopathologie et médecine translationnelle (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Recherche clinique et innovation technologique
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie, Médecine et santé

Mots-clés libres : Spectrométrie de masse, MALDI-TOF, Bactériologie, Hémocultures, Typage bactérien, Identification bactérienne, Epidémiologie, MALDIBiotyperTM, Microorganismes
Mots-clés :
  • Bactéries pathogènes - Classification
  • Spectrométrie de masse
  • Phénotype
  • Protéomique
  • Épidémiologie moléculaire
  • Résistance aux antibiotiques
  • Spectrométrie de masse MALDI - Dissertations universitaires
  • Techniques de typage bactérien - Dissertations universitaires
Résumé : L’objectif de mon travail fut de valider et d’optimiser la spectrométrie de masse de type MALDI-TOF pour l’identification et la classification d'un ensemble de bactéries pathogènes ou opportunistes chez l’homme, en enrichissant une base de données et en testant la robustesse de la méthode, afin d’obtenir une méthode rapide fixe et fiable d'acquisition de résultats. Les différents résultats obtenus ont permis la validation de la technique comme outil d’identification bactérienne fiable en routine. Elle permet désormais de caractériser les mélanges de deux bactéries voir même la différentiation d’espèces très proches comme les Shigella spp et E. coli. Nous avons montré que la technique sera encore améliorée par un outil supplémentaire de comparaison des souches pour une veille épidémiologique "en temps réel", sans investissement supplémentaire, en permettant plusieurs types d'économie. Elle apporte un gain réel dans la prise en charge du patient et le choix éclairé des antibiotiques testés pour l'antibiogramme. La technique peut aussi constituer un outil alternatif de sérotypage.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2012STRAJ124
Type de ressource : Thèse