Descripteurs fragmentaux enrichis par propriété pour QSAR adaptatif
Langue Anglais
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Auteur : Ruggiu, Fiorella
Date de soutenance : 22-09-2014

Directeur(s) de thèse : Varnek, Alexandre - Horvath, Dragos

Président : Taboureau, Olivier
Rapporteur(s) : Taboureau, Olivier - Sousa, João Aires de
Membre(s) du jury : Ertl, Peter - Kellenberger, Esther

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Chimie de la matière complexe (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale des Sciences chimiques (Strasbourg ; 1995-....)
 
Discipline : Chimie informatique et théorique
Classification : Chimie, minéralogie, cristallographie

Mots-clés libres : QSAR, Descripteurs moléculaires, Chémoinformatique
Mots-clés :
  • Criblage pharmacologique
  • QSAR (biochimie)
  • Antiprotéases
  • Chimie -- Informatique
Résumé : Les descripteurs ISIDA enrichis par propriété ont été introduit pour encoder les structures moléculaires en chémoinformatique en tant que nombre d’occurrence de sous-graphes moléculaires spécifiques dont les sommets représentant les atomes sont colorés par des propriétés locales tel que les pharmacophores dépendant du pH, les identifiants de champs de force, les charges partielles, les incréments LogP ou les propriétés extraites d’un modèle QSAR. Ces descripteurs, par leurs large choix d’option, permettent à l’utilisateur de les adapter au problème à modéliser. Ils ont été utilisés avec succès dans une étude de criblage virtuel sur des inhibiteurs de protéases et plusieurs modèles QSAR sur le coefficient de partage octanol-eau, l’index d’hydrophobicité chromatographique, l’inhibition du canal hERG, la constante de dissociation acide, la force des accepteurs de liaison hydrogène et l’affinité de liaison des GPCR.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2014STRAF037
Type de ressource : Thèse