Régulation de la methylation de l'ADN par les glycosylases MBD4 et TDG
Langue Anglais
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Modalités de diffusion de la thèse :
  • Thèse confidentielle jusqu'au 01/02/2018.
  • Thèse soumise à l'embargo de l'auteur jusqu'au 31/12/2016 (communication intranet).
 
Auteur : Ibrahim, Abdulkhaleg
Date de soutenance : 19-05-2015

Directeur(s) de thèse : Bronner, Christian

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie

Mots-clés libres : Déméthylation, MBD4, TGD, Glycosylase/lyase, Rétro-éléments, Oxydation, Protéines de réparation
Mots-clés :
  • ADN - Méthylation
  • Épigénétique
  • Méthylome
  • ADN -- Réparation
  • DNA Glycosylases - Dissertations universitaires
Résumé : Chez les mammifères, la méthylation est une marque épigénétique ciblant la cytosine principalement dans un contexte CpG pour produire une 5mC. 5mC est très sensible à une déamination spontanée ou enzymatique, conduisant à la formation d'un mésappariement G/T. La 5mCpeut également être oxydée pour former successivement la 5hmC, la 5fC et la 5caC. Ces modifications de la 5mC participent aux processus actifs de déméthylation de l’ADN. Chez les mammifères, la thymine, dans le mésappariement G/T, est clivée par TDG et MBD4. TDG est également en mesure d'exciser 5fC et 5caC. Cette thèse avait pour but de clarifier la fonction de TDG et MBD4 dans la dynamique de la 5mC. Nous avons montré que MBD4 est associée aux protéines de réparation des mésappariements. Les tests enzymatiques, in vitro, montrent que le complexe MBD4/MMR a une activité bifonctionnelle (glycosylase/lyase) spécifique pour G/T, qui est régulée par la méthylation. Pour TDG, nous avons ciblé cette enzyme dans les cellules MEF et caractérisé la distribution des cytosines modifiées. Les résultats montrent des profils de méthylation/oxydation d'ADN qui sont régulés par TDG et surviennent principalement au niveau des répétitions de CA et dans les rétroéléments spécifiques de la lignée souris.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2015STRAJ019
Type de ressource : Thèse