Outils bioinformatiques pour l'analyse génétique de la résistance du moustique Anopheles gambiae vis-à-vis des parasites du paludisme
Langue Français
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Modalités de diffusion de la thèse :
  • Thèse confidentielle jusqu'au 31/12/2016.
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Auteur : Vittu, Anaïs
Date de soutenance : 01-12-2015

Directeur(s) de thèse : Blandin, Stéphanie

Président : Imler, Jean-Luc
Rapporteur(s) : Seitz, Hervé - Colinge, Jacques
Membre(s) du jury : Imler, Jean-Luc

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Modèles Insectes de l'Immunité Innée (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Bioinformatique et biologie des systèmes
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie, Informatique

Mots-clés libres : Anopheles gambiae, Paludisme, Facteurs de résistance, Séquençage à très haut débit, Bioinformatique
Mots-clés :
  • Paludisme - Thérapeutique
  • Anophèles - Vecteurs de maladies
  • Résistance aux antipaludiques
  • Bioinformatique
  • Polymorphisme génétique
  • Séquençage nucléotidique à haut débit - Dissertations universitaires
Résumé : Au cours de ma thèse, j’ai développé et mis en place de nouvelles méthodes utilisant les récentes technologies du séquençage à très haut débit, des outils bioinformatiques et du «reciprocal allele-specifique RNA interference » (rasRNAi) dans l’objectif d’identifier les facteurs génétiques et non génétiques responsables de la résistance du moustique Anopheles gambiae aux parasites du paludisme murin Plasmodium berghei. J’ai mis en place une stratégie d’identification des polymorphismes dans les lignées résistantes et sensibles afin de sélectionner des marqueurs génétiques pour de futures analyses génétiques et lister les gènes polymorphiques. J’ai contribué à l’élaboration de nouvelles sondes ARN double-brin (dsRNAs) allèle spécifique pour la méthode du rasRNAi en identifiant le processus de découpage du dsRNA injecté chez des moustiques par l’analyse des petits ARNs séquencés issus du dsRNA injecté. J’ai élaboré un pipeline pour identifier la composition du microbiote des lignées sensibles et résistantes dans le but de les comparer.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2015STRAJ096
Type de ressource : Thèse