Etude des remaniements structuraux de l'ARN génomique du VIH-1 lors de la maturation des particules virales
Langue Anglais
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Modalités de diffusion de la thèse :
  • Thèse confidentielle jusqu'au 30/09/2019.
  • Thèse soumise à l'embargo de l'auteur jusqu'au 31/12/2018 (communication intranet).
 
Auteur : Mailler, Élodie
Date de soutenance : 22-09-2017

Directeur(s) de thèse : Marquet, Roland - Vivet-Boudou, Valérie

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie, Médecine et santé

Mots-clés libres : VIH-1, Maturation protéique, Maturation génomique, Cartographie chimique de l’ARN, Séquençage à haut débit, Structure secondaire de l’ARN, Activité chaperonne de l’ARN
Mots-clés :
  • Infections à VIH
  • Épissage (génétique)
  • Génomique
  • ARN viral
  • Molécules chaperonnes
Résumé : Le VIH-1 bourgeonne sous forme immature et doit subir l’étape de maturation afin d’acquérir son caractère infectieux. La maturation protéolytique du précurseur Pr55Gag induit le réarrangement morphologique de la particule alors que le dimère d’ARNg acquiert une compaction optimale. Ces réarrangements conformationnels restent encore inconnus et sont facilités par l’activité chaperonne de la protéine NCp7. Notre but a été de déterminer les différentes étapes menant à l’obtention d’un dimère d’ARNg mature. Nous avons donc étudié la structure des 550 premiers nucléotides du génome par cartographie chimique, à la fois 1. in vitro en présence des protéines Pr55Gag, GagΔp6, intermédiaires contenant le domaine NC et NCp7 et 2. in viro par l’approche hSHAPE-Seq que nous avons développé. Les particules matures et bloquées aux différentes étapes de maturation de Pr55Gag ont été analysées ainsi que des particules matures et totalement immatures traitées avec l’éjecteur de zinc AT-2. Ce traitement permet d’identifier les sites de protection de Pr55Gag et NCp7 ainsi que leur activité déstabilisatrice.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2017STRAJ055
Type de ressource : Thèse