Coévolution dans le gène pol du VIH-1 : un carrefour aux frontières de nouvelles espèces du VIH
Langue Français
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Auteur : Kanja, Marine
Date de soutenance : 28-09-2017

Directeur(s) de thèse : Negroni, Matteo

Président : Gouet, Patrice
Rapporteur(s) : Gouet, Patrice - Lavigne, Marc
Membre(s) du jury : Dimitrova, Maria

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg ; 1992-....)
École doctorale : École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie, Médecine et santé

Mots-clés libres : VIH, Intégrase, Réseaux de coévolution, Fonctionnalité
Mots-clés :
  • Intégrase du VIH
  • Transcription génétique
  • Coévolution
  • Transcription inverse - Dissertations universitaires
Résumé : L’intégrase (IN) est l’une des enzymes virales assurant la réplication du VIH. La fonctionnalité des protéines qui, comme celles du VIH, ont une variabilité de séquence repose sur des résidus non conservés, en plus des acides aminés conservés entre souches, qui ont un rôle important notamment lorsqu'ils font partie de réseaux de coévolution. Ces réseaux peuvent contrecarrer l'effet délétère d'une mutation par l'introduction de mutations compensatoires ailleurs dans la protéine. Ce travail a mis en évidence, par une étude comparative de différentes souches du VIH, des réseaux de coévolution étendus dans l'IN. Un résultat majeur est l'identification d'un nouveau motif assurant de multiples rôles dans le cycle infectieux. Le motif diffère entre les groupes M et O du VIH, mais est strictement conservé au sein de ces deux groupes en dépit d'une certaine flexibilité génétique en culture de cellules. Ceci suggère que ces groupes ont suivi des chemins évolutifs convergents bien que distincts.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2017STRAJ077
Type de ressource : Thèse