Reconstruction tomographique d'objets déformables pour la cryo-microscopie électronique à particules isolées
Langue Français
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Auteur : Michels, Yves
Date de soutenance : 26-09-2018

Directeur(s) de thèse : Tajine, Mohamed

Président : Schultz, Patrick
Rapporteur(s) : Kervrann, Charles - Lézoray, Olivier
Membre(s) du jury : Heinrich, Christian - Jonic, Slavica

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Laboratoire des sciences de l'ingénieur, de l'informatique et de l'imagerie (Strasbourg ; 2013-....)
École doctorale : École doctorale Mathématiques, sciences de l'information et de l'ingénieur (Strasbourg ; 1997-....)
 
Discipline : Informatique
Classification : Informatique, Sciences de l'ingénieur

Mots-clés libres : Tomographie, Réduction de dimension non linéaire, Reconstruction ab-initio, Estimation de paramètre, Problème inverse
Mots-clés :
  • Cryomicroscopie
  • Structure moléculaire
  • Tomographie
  • Reconnaissance d'objets (informatique)
Résumé : La cryo-microscopie électronique à particules isolées est une modalité d’imagerie permettant d’estimer la structure 3D de molécules. L’obtention d’un volume 3D est effectué par des algorithmes de reconstruction tomographique après acquisition par un microscope électronique à transmission d’un ensemble d’images de projection de l’objet observé. Les méthodes de reconstruction tomographique existantes permettent de déterminer la structure des molécules avec des résolutions proches de l’angström. Cependant la résolution est dégradée lorsque les molécules observées sont déformables. Les travaux réalisés au cours de cette thèse contribuent au développement de méthodes de traitement informatique des données (projections) dans le but de prendre en compte les déformations de l’objet observé dans le processus de reconstruction tomographique ab initio. Les problématiques principales abordées dans ce mémoire sont l’estimation des paramètres de projection basée sur la réduction de dimension non-linéaire, la détection des arêtes erronées dans les graphes de voisinages pour l’amélioration de la robustesse au bruit des méthodes de réduction de dimension, et la reconstruction tomographique basée sur un modèle paramétrique du volume.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2018STRAD031
Type de ressource : Thèse