Exploration de la transmission synaptique et de la régulation des récepteurs ionotropes par simulations de dynamique moléculaire et électrophysiologie numérique
Langue Anglais
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Auteur : Cerdan, Adrien
Date de soutenance : 08-02-2019

Directeur(s) de thèse : Cecchini, Marco

Président : Stote, Roland
Rapporteur(s) : Tarek, Mounir - Sansom, Mark
Membre(s) du jury : Cecchini, Marco - Stote, Roland - Tarek, Mounir - Sansom, Mark

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Institut de chimie (Strasbourg ; 2005-....)
École doctorale : École doctorale des Sciences chimiques (Strasbourg ; 1995-....)
 
Discipline : Chimie informatique et théorique
Classification : Chimie, minéralogie, cristallographie, Sciences de la vie, biologie, biochimie

Mots-clés libres : Dynamique moléculaire, Récepteur ionotrope, Électrophysiologie numérique, Récepteur de la glycine, Transmission synaptique, PLGIC, Allostérie
Mots-clés :
  • Glycine (acide aminé) - Récepteurs - Conformation
  • Dynamique moléculaire
  • Électrophysiologie
  • Allostérie
  • Canaux ioniques régulés par des ligands
  • Conformation d'acide nucléique
Résumé : Au niveau de la synapse, la liaison des neurotransmetteurs aux récepteurs membranaires induit l’ouverture de canaux ioniques. Le Récepteur de la Glycine (RGly) est un récepteur ionotrope impliqué dans des troubles neuronaux tels que l’addiction, la douleur chronique, ou l’hyperekplexie ; pour cette raison il est important de développer des nouveaux traitements ciblant ce récepteur. Nous avons utilisé des simulations de Dynamiques Moléculaire (DM) et d’électrophysiologie numérique afin d’évaluer la fonction des structures du RGly disponibles et montré qu’aucune d’entre elles ne satisfait les propriétés fonctionnelles de l’état ouvert. Grâce aux simulations de DM, nous avons caractérisé une nouvelle conformation du RGly, qui est compatible avec cet état. Nous avons souligné le rôle majeur des portails latéraux pour la perméation des ions. Nous avons proposé un protocole, nommé pharmacologie dépendante de l’état, pour identifier des molécules modulatrices de protéines allostériques.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2019STRAF006
Type de ressource : Thèse