Développement de méthodes analytiques par spectrométrie de masse pour une meilleure quantification et une caractérisation fine des protéomes
Langue Anglais
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Modalités de diffusion de la thèse :
  • Thèse confidentielle jusqu'au 04/12/2020.
  • Thèse soumise à l'embargo de l'auteur : embargo illimité (communication intranet).
 
Auteur : Bons, Joanna
Date de soutenance : 03-12-2019

Directeur(s) de thèse : Carapito, Christine - Cianférani-Sanglier, Sarah

Président : Rabilloud, Thierry
Rapporteur(s) : Pflieger, Delphine - Schilling, Oliver S.
Membre(s) du jury : Carapito, Christine - Cianférani-Sanglier, Sarah - Rabilloud, Thierry - Pflieger, Delphine - Schilling, Oliver S. - Gillet, Ludovic

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Institut pluridisciplinaire Hubert Curien (Strasbourg ; 2006-....)
École doctorale : École doctorale des Sciences chimiques (Strasbourg ; 1995-....)
 
Discipline : Chimie analytique
Classification : Chimie, minéralogie, cristallographie, Sciences de la vie, biologie, biochimie

Mots-clés libres : Protéomique, Spectrométrie de masse, Quantification globale, Quantification ciblée, Acquisition indépendante des données (DIA)
Mots-clés :
  • Protéome
  • Protéomique - Informatique
  • Analyse quantitative (chimie) - Méthodologie
  • Exosomes
Résumé : La protéomique quantitative est un atout considérable pour l’étude des systèmes biologiques à l’échelle protéique, comme en témoigne le large panel de stratégies disponibles. Celui-ci peut être subdivisé de la sorte : stratégies globales, stratégies ciblées et stratégies DIA qui combinent les avantages des deux précédentes. Ce travail de thèse est focalisé sur le développement de méthodes de protéomique quantitative afin d’améliorer la quantification et la caractérisation des protéomes. Le principal verrou résidant dans l’analyse des données, la première partie de mon travail a consisté à évaluer différents logiciels de traitement des données DIA. Suite aux développement et optimisations de différentes méthodes de quantification dans des contextes biologiques variés, leurs performances ont été évaluées afin de répondre au mieux aux questions biologiques posées. Enfin, différentes stratégies analytiques ont été développées afin de caractériser finement des protéomes d’entités cellulaires, à savoir le protéome mitochondrial humain, le contenu protéique d’exosomes tumoraux et d’entités biologiques encapsulées dans les microgouttelettes.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2019STRAF054
Type de ressource : Thèse