Détection des ARNs viraux par Dicer-2 chez la drosophile
Langue Anglais
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Modalités de diffusion de la thèse :
  • Thèse confidentielle jusqu'au 31/12/2022.
 
Auteur : Talide, Loic
Date de soutenance : 22-10-2019

Directeur(s) de thèse : Meignin, Carine

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Modèles Insectes de l'Immunité Innée (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie

Mots-clés libres : Dicer-2, D. melanogaster, Dicistrovirus, Séquençage à haut débit
Mots-clés :
  • ARN viral
  • Séquençage nucléotidique à haut débit
  • ARN interférence
  • Drosophila melanogaster
  • Interférence par ARN
  • Ribonuclease III
Résumé : Je me suis intéressé au système de défense anti-viral majeur de Drosophila melanogaster qui est la voie du RNA silencing (siRNA). A ce jour, le seul senseur d’acide nucléique viral et activateur de la voie siRNA est Dicer-2. Ainsi, le travail que j’ai effectué́ a permis d’apporter de nouvelles informations concernant la détection des ARNs viraux par Dicer-2. L’utilisation de méthodes de séquençage à haut débit (HTS) des petits ARNs dans des cellules S2 infectées par le Drosophila C Virus (DCV) à des temps précoces m’a permis de proposer un point d’entrée précis et interne de Dicer-2 sur l’ARN double brin de ce dicistrovirus. La validation de ce point faible dans la défense du virus a été effectuée en réalisant un HTS des petits ARNs dans des mouches de différents génotypes infectées avec DCV. J’ai ensuite caractérisé plus en profondeur cette région du génome virale en déterminant tout d’abord sa structure 2D puis sa sensibilité à des clivages médiés par des extraits embryonnaires de mouches. Finalement, l’utilisation de différents variants de Dicer-2 présentant des mutations du domaine DRA m’a permis de proposer un nouveau mécanisme de fonctionnement de cette protéine.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2019STRAJ036
Type de ressource : Thèse