Élucidation de l'architecture génétique des traits dans une population naturelle de levures
Langue Anglais
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Modalités de diffusion de la thèse :
  • Thèse soumise à l'embargo de l'auteur jusqu'au 27/09/2020 (communication intranet).
 
Auteur : Fournier, Téo
Date de soutenance : 27-09-2019

Directeur(s) de thèse : Schacherer, Joseph - Montigny, Jacky de

Président : Dujon, Bernard
Rapporteur(s) : Landry, Christian R. - Rockman, Matthew V.
Membre(s) du jury : Schacherer, Joseph - Montigny, Jacky de - Dujon, Bernard - Landry, Christian R. - Rockman, Matthew V. - Blandin, Stéphanie

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Génétique moléculaire, génomique et microbiologie (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie

Mots-clés libres : Levures, Génétique des populations, Héritabilité manquante, Architecture génétique des traits
Mots-clés :
  • Variabilité génétique
  • Phénotype
  • Génotype
  • Séquençage à haut débit
  • Saccharomyces cerevisiae
Résumé : Comprendre les règles contrôlant la diversité entre individus issus d’une même population est l’un des points centraux de la biologie moderne. Récemment, l'avènement des études d’association pan-génomique a permis de lier le génotype au phénotype au sein de populations. Cependant, une part importante de la variance phénotypique reste inexpliquée et est appelée héritabilité manquante. En combinant le modèle d’étude Saccharomyces cerevisiae, un design emprunté à la génétique classique et des stratégies de phénotypage et de génotypage à haut-débit, ce travail a pour objectif d’élargir notre compréhension des causes de cette héritabilité manquante à l’échelle de l’espèce. Nous avons donc pu quantifier l’impact des variants rares, obtenir une image globale du spectre de la complexité génétique des phénotypes ainsi que mesurer l’impact du fonds génétique sur cette complexité. Enfin, grâce à des techniques de séquençage utilisant de longs fragments d’ADN, une solide base pour l'identification de variants structuraux dans des populations naturelles de levures a été bâtie, permettant d’obtenir une première vue des effets phénotypiques de tels variants.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2019STRAJ073
Type de ressource : Thèse