Développement de stratégies analytiques en protéomique quantitative : quantification des protéines de la cellule hôte par spectrométrie de masse comme outil de contrôle qualité pour l’industrie biopharmaceutique
Langue Anglais
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Modalités de diffusion de la thèse :
  • Thèse confidentielle jusqu'au 31/12/2022.
  • AccŽs réservé à l'ensemble de la communauté universitaire jusqu'au 31/12/2022 (communication intranet).
 
Auteur : Hessmann, Steve
Date de soutenance : 06-12-2021

Directeur(s) de thèse : Carapito, Christine

Président : Ferro, Myriam
Rapporteur(s) : Ferro, Myriam - Bracewell, Daniel
Membre(s) du jury : Cherry, Cyrille - Cianférani-Sanglier, Sarah - O'Hara, John

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Institut pluridisciplinaire Hubert Curien (Strasbourg ; 2006-....)
École doctorale : École doctorale des Sciences chimiques (Strasbourg ; 1995-....)
 
Discipline : Chimie analytique
Classification : Chimie, minéralogie, cristallographie

Mots-clés libres : Protéomique quantitative, Spectrométrie de masse, Acquisition indépendantes des données (DIA), Protéines de la cellule hôte (HCPs)
Mots-clés :
  • Chimie analytique
  • Protéomique
  • Spectrométrie de masse
Résumé : Les stratégies de protéomique quantitative par spectrométrie de masse sont très attractives pour le suivi des protéines de la cellule hôte lors de la production d’anticorps thérapeutiques. Elles peuvent être divisées en trois catégories : les stratégies globales, les stratégies ciblées et les stratégies DIA qui combinent les avantages des deux précédentes.Ce travail de thèse est articulé sur le développement de stratégies analytiques et bioinformatiques en protéomique quantitative pour l’identification et la quantification d’impuretés protéiques à l’état de traces. La première partie de mon travail implique les optimisations de différentes étapes du protocole analytique en me concentrant sur un standard de quantification innovant, le mode d’acquisition DIA et le traitement de ces données complexes. Ces développements ont été réalisées afin d’assister les différentes étapes de la chaine de production des anticorps. Par la suite, une méthode de quantification globale a été optimisées pour le suivi des impuretés protéiques présentes dans les substances médicamenteuses finales qui représentes un véritable défi analytique. Enfin, La troisième partie a consisté à développer une stratégie analytique ciblée sur une plateforme MS dédiée à l'analyse de routine.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2021STRAF035
Type de ressource : Thèse