Caractérisation de la machinerie traductionnelle à l'aide de criblages à ultra haut-débit en goutelettes microfluidiques
Langue Français
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Auteur : Dentz, Natacha
Date de soutenance : 10-09-2021

Directeur(s) de thèse : Ryckelynck, Michaël

Président : Becker, Hubert
Rapporteur(s) : Guillier, Maude - Gautier, Arnaud
Membre(s) du jury : Faulon, Jean-Loup

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg ; 1992-....)
École doctorale : École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie

Mots-clés libres : Initiation de la traduction, Expression in vitro, Criblage à ultrahaut-débit, Microfluidique en gouttelettes
Mots-clés :
  • Traduction génétique
  • Expression génique
  • Criblage pharmacologique
Résumé : La traduction est un procédé énergivore finement régulé et ce, majoritairement lors de son initiation. Que ce soit au travers de systèmes procaryotes ou eucaryotes, l’étude de ce mécanisme et de sa régulation nécessitent l’analyse d’un grand nombre de variants rendant ces travaux chronophages et onéreux. Les criblages in vivo à haut-débit étant efficaces mais limités par les variations intercellulaires ou par certaines conditions toxiques ont motivé́ l’emploi de milieux de transcription, traduction in vitro (TTIV). Toutefois, l’analyse de millions de variants par ces approches in vitro est rapidement limitée par le coût, d’où l’intérêt de la microfluidique en gouttelettes qui, par l’utilisation de gouttelettes d’eau dans l’huile de quelques picolitres, permet la réduction du volume, du coût mais aussi du temps de travail. L’ensemble associé au séquençage à haut-débit (NGS) et à l’analyse bio-informatique permet alors une étude rapide et exhaustive des séquences. Dans le cadre de cette thèse, une plateforme de criblage de microfluidique en gouttelettes a été utilisée pour l’analyse de l’initiation de la traduction chez les procaryotes et les eucaryotes ainsi que pour l’étude de certains mécanismes de sa régulation. Plusieurs preuves de principes clefs ont été établies et les perspectives qu’elles ouvrent sont analysées et discutées.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2021STRAJ027
Type de ressource : Thèse