Caractérisation de la variation d’expressivité au sein d’une population
Langue Anglais, Français
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Auteur : Caudal, Élodie
Date de soutenance : 22-09-2021

Directeur(s) de thèse : Schacherer, Joseph

Président : Meignin, Carine
Rapporteur(s) : Dujon, Bernard - Marullo, Philippe
Membre(s) du jury : Wincker, Patrick

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Génétique moléculaire, génomique et microbiologie (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie

Mots-clés libres : Relations génotype-phénotype, Génomique des populations, Levure, GWAS, Transcriptome, Mutagénèse par insertion de transposons
Mots-clés :
  • Génétique des populations
  • Phénotype
  • Saccharomyces cerevisiae
Résumé : L’élucidation des origines génétiques des traits complexes reste une problématique majeure en biologie. Ces dix dernières années, les projets de reséquençage de milliers d’individus d’une même espèce ont permis d’explorer la diversité génétique au sein des génomes. Des études d’association pangénomique ont alors été initiées pour identifier les variants génétiques impliqués dans la variance phénotypique observée dans des populations étudiées. Cependant, les variants détectés n’expliquent qu’une portion plus ou moins importante de la variance phénotypique. Mieux caractériser la relation entre génotypes et phénotypes a ainsi été la base de mes travaux de thèse. Pour cela, une collection de plus de 1000 isolats naturels de Saccharomyces cerevisiae divers et séquencés a été une ressource clé pour disséquer dans un premier temps les origines génétiques de la variation du niveau d’expression de plus de 6000 gènes au sein de cette espèce. Dans un second temps, une stratégie de mutagénèse par insertion de transposons réalisée dans une centaine d’isolats de levure a permis d’estimer dans quelles proportions le fonds génétique impacte la variation des phénotypes.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2021STRAJ035
Type de ressource : Thèse