Proximité entre promoteur et enhancer et l’étude de leurs propriétés de diffusion au cours de la transcription
Langue Anglais
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Auteur : Platania, Angeliki
Date de soutenance : 23-07-2021

Directeur(s) de thèse : Sexton, Thomas

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie

Mots-clés libres : Sox2, Dynamique de la chromatine, Imagerie en direct, Transcription, ARN Pol II
Mots-clés :
  • Promoteurs (génétique)
  • Facteurs de transcription
  • Chromatine
Résumé : Le lien entre la dynamique de la chromatine et la transcription reste flou, notamment parce que très peu de loci ont été évalués. Dans cette étude, en utilisant le locus autour du gène de la pluripotence Sox2 comme modèle, j'ai réalisé un double marquage pour suivre la communication et la mobilité du promoteur et de l'enhancer, couplé à un marquage de l'ARN naissant de Sox2 et étudié la dynamique de la machinerie protéique transcriptionnelle. Contrairement à une étude précédente, j'ai observé́ que Sox2 est très proche de son enhancer mais aussi, que leur distance de séparation n'est pas totalement corrélée avec l’activation de la transcription. La perturbation de l'expression de Sox2 lors de la différenciation des cellules, des délétions de parties de l'enhancer et de l'inhibition de l'initiation transcriptionnelle, ont montré́ que la mobilité́ est augmentée spécifiquement au niveau du promoteur de Sox2 en même temps que l'activation de la transcription. Cependant,les loci participant à l’activation de la transcription ne présentent pas une dynamique chromatinienne sensiblement différente lorsqu’ils sont transcriptionnellement inactifs.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2021STRAJ102
Type de ressource : Thèse