Les interactions hôte-microbiote dans la pathogenèse des maladies inflammatoires intestinales pédiatriques
Langue Anglais
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Auteur : Schramm, Laëtitia
Date de soutenance : 22-03-2022

Directeur(s) de thèse : Heintz, Dimitri - Stintzi, Alain

Président : Bringel, Françoise
Rapporteur(s) : Baysse, Christine - Santos, Manuela
Membre(s) du jury : Figeys, Daniel

Établissement de soutenance : Strasbourg - Université d'Ottawa
Laboratoire : Institut de biologie moléculaire des plantes (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Sciences de la vie et de la santé
Classification : Médecine et santé

Mots-clés libres : Interactions hôte-microbiote, Analyses multi-omiques, Maladies inflammatoire chroniques de l’intestin, Microbiote intestinal
Mots-clés :
  • Maladies inflammatoires chroniques de l'intestin - Chez l'enfant
  • Relations hôte-bactérie
  • Flore intestinale
Résumé : La cause exacte des maladies inflammatoires intestinales (MII) reste mal connue. Il est de plus en plus accepté que le microbiote intestinal joue un rôle clé dans le développement et la progression de l’inflammation dans la pathologie des MII. De plus en plus d’études visent à caractériser et comparer la composition du microbiote intestinal des patients atteints de MII. Cependant la plupart des travaux sur le microbiote sont réalisés sur des patients adultes et sous traitement. L’objectif de notre travail est d’apporter une meilleure compréhension des interactions entre le microbiote intestinal et son hôte, dans le contexte des MII. Nous avons réalisé une analyse multi-omique de lavements intestinaux obtenus au moment du diagnostic chez des enfants atteint de la maladie de Crohn (MC) et de la rectocolite hémorragique (RCH), permettant l’étude des relations entre l’hôte et ses bactéries au niveau de l’interface muqueuse-lumière de deux régions distinctes du colon. Ainsi, la composition du microbiote intestinal des patients atteints de MII diffère des sujets contrôles, et se caractérise notamment par une augmentation de l’abondance relative des bactéries produisant du sulfure d’hydrogène (H2S) et une diminution de l’abondance relative des bactéries produisant du butyrate. Cette différence est particulièrement marquée au sein du colon distal. De la même manière, le profil métabolique des sujets MII diffèrent de celui des individus contrôles, avec une augmentation des niveaux relatifs de certains acides aminés, dipeptides, pesticides et molécules produites par les microbes. Certains métabolites tels que la taurine, l’oxazole et le mecarbam-f7 ont montré une corrélation positive avec les bactéries productrices d’H2S, tandis que les producteurs de butyrates étaient négativement corrélés avec ces mêmes composés. Enfin, l’expression de gènes microbiens impliqués dans la réponse au stress oxydatif, la virulence bactérienne, le métabolisme du fer et la biosynthèse de clusters fer-souffre est augmentée notamment dans le colon proximal des patients atteints de MII. Ce travail a permis d’ouvrir des pistes quant aux interactions entre l’hôte et son microbiote intestinal dans le contexte des MII. Une meilleure compréhension et un approfondissement des relations hôte-bactéries permettront d’apporter de nouvelles stratégies thérapeutiques dans le traitement et la gestion des MII.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2022STRAJ009
Type de ressource : Thèse