Étude de la biogenèse et des fonctions des petits ARN non codants dérivant d'ARN de transfert chez Arabidopsis thaliana
Langue Français
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Modalités de diffusion de la thèse :
  • Thèse confidentielle jusqu'au 28/06/2023.
 
Auteur : Chery, Marjorie
Date de soutenance : 29-06-2022

Directeur(s) de thèse : Drouard, Laurence

Président : Remacle, Claire
Rapporteur(s) : Remacle, Claire - Merret, Rémy
Membre(s) du jury : Lelandais-Brière, Christine - Gagliardi, Dominique

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Institut de biologie moléculaire des plantes (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie

Mots-clés libres : ARNt, TRF, RNase T2, RNS, Hélicase, DExH1, G-quadruplex
Mots-clés :
  • ARN de transfert
  • ARN non codants
  • Arabidopsis thaliana
Résumé : Les petits ARN non codants dérivant des ARN de transfert (tRFs) ont été identifiés dans tous les domaines de la vie et sont impliqués dans des mécanismes biologiques variés. Mon travail de thèse, mené sur la plante modèle Arabidopsis thaliana, a eu pour but de mieux comprendre la biogenèse des tRFs et leurs fonctions chez les plantes. Des lignées stables n’exprimant pas les trois principales RNases T2, RNS1, 2 et 3, acteurs majeurs de la biogenèse des tRFs, ont été réalisées avec la technologie CRISPR/Cas9. De plus, le tRF-5D Ala (AGC) de 20 nucléotides, montré précédemment comme inhibant la traduction in vitro, a été utilisé comme modèle pour déterminer sa fonction. Des protoplastes d’A. thaliana ont été transfectés avec ce tRF pour observer sa localisation subcellulaire et identifier ses partenaires protéiques. Celui-ci est retrouvé accumulé dans des foci cytosoliques qui ne s’apparentent pas à des mitochondries, P-bodies ou granules de stress. Une hélicase ARN,DExH1, interagissant avec des G-quadruplex, a été retrouvée associée avec le tRF Ala et la présence de structure en G-quadruplex sur le tRF Ala a été confirmée in vitro. Les résultats obtenus suggèrent que le tRF Ala structuré en G-quadruplex peut être stocké dans la cellule et que DExH1 interviendrait pour le relâcher sous forme non structurée.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2022STRAJ034
Type de ressource : Thèse