Conception rationnelle de molécules bioactives à portée antibiotique
Langue Anglais
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Modalités de diffusion de la thèse :
  • Thèse confidentielle jusqu'au 15/09/2024.
  • Thèse soumise à l'embargo de l'auteur jusqu'au 15/09/2024 (communication intranet).
 
Auteur : Revillo imbernon, Julia
Date de soutenance : 15-09-2023

Directeur(s) de thèse : Kellenberger, Esther

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Laboratoire d'innovation thérapeutique (Strasbourg ; 2009-....)
École doctorale : École doctorale Sciences chimiques (Strasbourg ; 1995-....)
 
Discipline : Chimie informatique et théorique
Classification : Chimie, minéralogie, cristallographie

Mots-clés libres : Antibiotiques, Aminoglycosides, Enzymes de modification des aminoglycosides, Anneau de réplication bactérien, Conception de médicaments, Conception de médicaments par fragments, Screening virtuel, Dynamique moléculaire
Mots-clés :
  • Antibiotiques
  • Aminosides
  • Dynamique moléculaire
Résumé : La montée de la résistance aux antibiotiques représente une menace significative pour la santé humaine. Ce manuscrit aborde cette problématique à travers deux projets de recherche collaboratifs et interdisciplinaires : (1) l'optimisation de la néomycine B, un antibiotique de la classe des aminoglycosides, et (2) la recherche de petites molécules pour une nouvelle cible, l'anneau β bactérien.(1) Nous avons développé une méthodologie basée sur la structure tridimensionnelle pour prédire l'effet de modification de la néomycine B sur l'action des enzymes bactériennes de modification des aminoglycosides (AME). Cette méthodologie utilise la simulation de dynamique moléculaire pour évaluer la stabilité des modes de liaison, et a été mise au point en considérant cinq AMEs présentes dans des souches cliniques et le dérivé HL_171.(2) Nous avons mis en place une stratégie de criblage virtuel inspirée des données structurales obtenues pour 73 fragments de la chimiothèque Diamond DLS et cinq peptides inhibiteurs issus de protéines liant l'anneau β bactérien et impliquées dans la réplication de l'ADN. Nous avons priorisé une centaine de molécules disponibles commercialement, et qui sont actuellement évaluées par nos collaborateurs biologistes.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : not initialized
Identifiant : 2023STRAF037
Type de ressource : Thèse