Caractérisation du rôle de l’exoribonucléase DIS3L2 et du complexe protéique SKI lors d’une infection virale
Langue Français
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Modalités de diffusion de la thèse :
  • Thèse confidentielle jusqu'au 31/12/2024.
 
Auteur : Amrani, Yasmine
Date de soutenance : 13-10-2023

Directeur(s) de thèse : Pfeffer, Sébastien - Séraphin, Bertrand

Président : Dimitrova, Maria
Rapporteur(s) : Muylkens, Benoit - Demeret, Caroline
Membre(s) du jury : Briant, Laurence

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg ; 1992-....)
École doctorale : École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie

Mots-clés libres : Dégradation des ARN, Complexe SKI, Exoribonucléase DIS3L2, Virus de Sindbis
Mots-clés :
  • Cellules eucaryotes
  • Virus à ARN monocaténaire
  • Ribonucléases
Résumé : Chez les eucaryotes, les voies de dégradation des ARN régulent l'abondance des transcrits et assurent un contrôle qualité en éliminant les ARN défectueux. Le complexe SKI agit dans le cytoplasme en tant que co-facteur de l'exosome, stimulant la dégradation des ARN par leur extrémité 3'. La ARN de 3' en 5' est également assurée par l'exoribonucléase DIS3L2. Dans le cadre de notre proiet, nous avons étudié le rôle de DIS3L2 et du complexe SKI lors d'une infection par le virus de Sindbis (SINV) dans des lignées mutantes pour ces facteurs protéiques. Nos résultats indiquent un effet limité de DIS3L2 sur l'infection virale. Néanmoins, nous avons démontré que les lignées n'exprimant plus SKIC2 et SKIC3, deux des sous-unités du complexe SKI, présentent une baisse significative de l'infection virale. Ceci suggère un effet proviral de ces deux protéines lors de l'infection par le SINV, une hypothèse qui a été confirmée par d'autres approches d'extinction de gènes (siARN). Ensuite, nous avons restauré l'expression de SKIC2 et nous avons démontré que l'effet proviral observé est bien attribuable à SKIC2. Une analyse plus approfondie des mécanismes moléculaires, notamment par l'analyse des interactions protéiques modulées par l'infection par le SINV, devrait nous permettre de mieux comprendre le rôle du complexe SKI lors d'une infection virale.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2023STRAJ113
Type de ressource : Thèse