Reconstruction à partir de particules isolées en microscopie par fluorescence
Langue Français
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Auteur : Eloy, Thibaut
Date de soutenance : 20-09-2024

Directeur(s) de thèse : Baudrier, Etienne

Président : Jonic, Slavica
Rapporteur(s) : Kervrann, Charles - Denis, Loïc
Membre(s) du jury : Fortun, Denis - Soubies, Emmanuel - Liebling, Michael

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Laboratoire des sciences de l'ingénieur, de l'informatique et de l'imagerie (Strasbourg ; 2013-....)
École doctorale : École doctorale Mathématiques, sciences de l'information et de l'ingénieur (Strasbourg ; 1997-....)
 
Discipline : Informatique
Classification : Sciences de l'ingénieur

Mots-clés libres : Microscopie par fluorescence, Problème inverse, Optimisation hiérarchique, Anisotropie de résolution, Reconstruction, Assemblages macromoléculaires, Centriole, Biologie structurale, Hétérogénéité des conformations
Mots-clés :
  • Microscopie de fluorescence
Résumé : La microscopie par fluorescence, technique de microscopie optique permettant l’acquisition d’images tridimensionnelles, a connu des avancées majeures ces dernières décennies grâce au développement des méthodes de super-résolution optique et de la microscopie par expansion. Cette technique de microscopie commence même à émerger comme un outil prometteur pour la biologie structurale, discipline qui étudie la structure tridimensionnelle des assemblages macromoléculaires afin de comprendre leurs rôles dans les mécanismes cellulaires. Néanmoins, ces progrès sont freinés par deux limitations principales. D’une part, l’anisotropie de résolution : la résolution selon l’axe du microscope est de 3 à 5 fois inférieure à la résolution dans le plan latéral. D’autre part, le faible degré de labellisation (DL) : les fluorophores utilisés pour labelliser les protéines d’intérêts Dun assemblage macromoléculaire, ne couvrent pas uniformément la structure observée. L’anisotropie de résolution et le faible DL sont des limitations physiques intrinsèques au processus d’acquisition. L’objectif de la thèse est de les contourner à l’aide de l’outil numérique en développant une méthode de reconstruction à partir de particules isolées (RPI). Le principe consiste à combiner plusieurs acquisitions de particules biologiques identiques observées selon différentes orientations inconnues à n de reconstruire un modèle de particule. Grace à la fusion des informations complémentaires dans chaque vue, nous visons à reconstruire un volume avec une résolution isotrope et une densité de labellisation uniforme.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2024STRAD032
Type de ressource : Thèse