Caractérisation d'un module du complexe CCR4-NOT ciblant des ARNm codant pour des protéines potentiellement délétères
Langue Français
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  • Thèse confidentielle jusqu'au 31/12/2025.
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Auteur : Caulier, Guillaume
Date de soutenance : 19-12-2024

Directeur(s) de thèse : Mauxion, Fabienne - Séraphin, Bertrand

Président : Sauter, Claude
Rapporteur(s) : Badis-Bréard, Gwenaël - Rougemaille, Mathieu
Membre(s) du jury : Stutz, Françoise

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie, Médecine et santé

Mots-clés libres : Complexe CCR4-NOT, NAC, Ribosome, Dégradation de l’ARNm, Traduction, Levure
Mots-clés :
  • ARN messagers - Détérioration
  • Régulation génétique
  • Interactions ARN-protéine
  • Nucléoprotéines
Résumé : Un mécanisme de dégradation co-traductionnelle des ARN messagers (ARNm) codant des protéines aberrantes et/ou des polypeptides présents en excès a été identifié chez divers eucaryotes, mais reste mal compris. L'accumulation de ces protéines est à l'origine de maladies (appelées collectivement protéinopathies) et de cancers chez l'homme. Ce mécanisme implique la dégradation des queues poly(A) des ARNm codant des protéines mal repliées par le complexe CCR4-NOT, la principale deadenylase eucaryote. Chez S. cerevisiae, ce processus implique Caf130, dont il a été démontré qu'il régule le niveau des ARNm codant pour la protéine ribosomale Rpl4, lorsque cette dernière est mal repliée. Les données publiées ainsi que nos propres résultats biochimiques soutiennent une interaction entre Caf130, sous-unité du CCR4-NOT, et Btt1, sous-unité du NAC, impliqué dans le repliement des polypeptides naissants. Afin d'élucider ce mécanisme, nous avons caractérisé le module du CCR4-NOT impliqué, en combinant purifications biochimiques, tests d’interactions protéiques et modélisation AlphaFold, pour en définir l'organisation. Ces études structurales et fonctionnelles offriront une compréhension globale de ce système de contrôle de qualité.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2024STRAJ054
Type de ressource : Thèse