Dynamique structurale du récepteur nucléaire PPARgamma
Langue Anglais
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Modalités de diffusion de la thèse :
  • Thèse confidentielle jusqu'au 31/12/2025.
  • Thèse avec 2 versions : seule la version intégrale est proposée ; sur authentification (communication intranet).
 
Auteur : Milinski, Ana
Date de soutenance : 17-12-2024

Directeur(s) de thèse : Stote, Roland - Dejaegere, Annick

Président : Baud, Stéphanie
Rapporteur(s) : Baud, Stéphanie - Zoete, Vincent
Membre(s) du jury : Le Maire-Coirier, Albane - Spichty, Martin‏

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Biophysique et biologie structurale
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie

Mots-clés libres : PPARgamma, Récepteur nucléaire, Dynamique moléculaire, Mouvements corrélés
Mots-clés :
  • Récepteur PPAR gamma
  • Récepteurs nucléaires (biochimie)
  • Dynamique moléculaire - Modèles mathématiques
  • Facteurs de transcription
Résumé : PPARgamma est un régulateur du métabolisme des lipides, et les changements dans sa dynamique structurale sont impliqués dans de nombreux processus physiologiques et pathologiques. L’étude au niveau atomique des mécanismes moléculaires sous-tendant ces effets dynamiques implique de caractériser les mouvements, et en particulier les mouvements collectifs. L'objectif de cette thèse était de développer une nouvelle approche pour mesurer les propriétés physiques directement liées aux changements dans la dynamique structurale collective à basse fréquence des protéines. Nous présentons une méthodologie originale qui combine des simulations de dynamique moléculaire et de la spectroscopie IR lointain, appelée « Ensemble Averaged Normal Modes ». Le protocole développé a été appliqué à PPARgamma, en particulier son domaine de liaison au ligand (LBD) sauvage dans les formes apo et holo (lié à l'agoniste GW1929) ainsi qu’à deux mutants associés au cancer (T4757M et F310S). Une deuxième étude portait sur des effets de la polarisation sur les mouvements collectifs de PPARgamma.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2024STRAJ074
Type de ressource : Thèse