Caractérisation des facteurs moléculaires modulant l’interaction de Pr55Gag à l’ARN génomique du VIH-1 en vue de l’assemblage des particules virales
Langue Anglais
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Auteur : Welker, Lisa
Date de soutenance : 15-11-2024

Directeur(s) de thèse : Bernacchi, Serena - Ruff, Marc

Président : Gouet, Patrice
Rapporteur(s) : Gouet, Patrice - Mougel, Marylène
Membre(s) du jury : Anton, Halina - Lesbats, Paul

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg ; 1992-....) - Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Biophysique et biologie structurale
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie

Mots-clés libres : VIH-1, Assemblage viral, Gag, ARNg, Membrane, Interactions protéines, ARN, Interactions protéines, Lipides
Mots-clés :
  • Protéines virales - Précurseurs
  • Génétique virale
  • Interactions ARN-protéine
  • Assemblage viral
Résumé : Dans le cytoplasme le précurseur Gag du VIH-1, sélectionne l’ARN génomique (ARNg) viral en interagissant spécifiquement avec sa région 5' UTR. Ensuite, Gag permet l’ancrage de l’ARNg aux sites d’assemblage à la membrane plasmique (MP). A ces sites, pour construire la particule virale, environ 2500 copies de Gag oligomérisent sur l’ensemble de l’ARNg . Cela suggère qu’à ce stade les interactions entre Gag et la 5’UTR de l’ARNg doivent devenir non spécifiques. Lors de ma thèse j’ai cherché à caractériser le rôle des facteurs moléculaires tels que l’association de Gag à la MP et sa multimérisation aux sites d’assemblage, sur la spécificité des interactions Gag – 5’UTR de l’ARNg. Cette étude, conduite par microcopie confocale dans un système in vitro imitant les sites d’assemblage du VIH-1, a permis de mettre en évidence que i) l’association de Gag à la membrane induit des changements dans le mode de liaison Gag – 5’UTR de l’ARNg, ii) l’interface de symétrie triple sur le réseau d’assemblage de la capside est requise pour l’interaction à forte affinité entre Gag et la 5’UTR et iii) la protéine Gag s’assemble de manière plus efficace à la membrane lorsqu’elle interagit avec la 5’UTR de l’ARNg plutôt qu’un autre ARN. En parallèle, pour caractériser les interactions Gag–ARNg à la membrane à l’échelle atomique, j’ai mis en place des stratégies permettant de former des complexes lipides-Gag et lipides-Gag-5’UTR de l’ARNg sur des grilles de cryo-microscopie électronique fonctionnalisées avec des monocouches lipidiques ou des liposomes.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2024STRAJ111
Type de ressource : Thèse