Vers des protocoles innovants en pontage chimique suivi par spectrométrie de masse (XL-MS) pour l’étude des interactions protéiques in-vitro et in-situ
Langue Anglais
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Modalités de diffusion de la thèse :
  • Thèse confidentielle jusqu'au 10/07/2026.
  • Thèse avec 2 versions : seule la version intégrale est proposée ; sur authentification (communication intranet).
 
Auteur : Gizardin-Fredon, Hugo
Date de soutenance : 10-07-2025

Directeur(s) de thèse : Cianférani-Sanglier, Sarah

Président : Chamot-Rooke, Julia
Rapporteur(s) : Chamot-Rooke, Julia - Scheltema, Richard Alexander
Membre(s) du jury : Schmidt, Carla - Albanese, Pascal

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Institut pluridisciplinaire Hubert Curien (Strasbourg ; 2006-....)
École doctorale : École doctorale des Sciences chimiques (Strasbourg ; 1995-....)
 
Discipline : Chimie analytique
Classification : Chimie, minéralogie, cristallographie

Mots-clés libres : Spectrométrie de masse structurale, Pontage chimique suivi par spectrométrie de masse, Complexes multi-protéiques, Interactomique, Biologie structurale
Mots-clés :
  • Chimie analytique
  • Spectrométrie de masse
Résumé : Cette thèse présente des développements méthodologiques en pontage chimique couplé à la spectrométrie de masse (XL-MS) pour l’étude des interactions protéines-protéines. Une approche innovante de photométrie de masse dénaturante a d’abord été mise au point pour suivre les réactions de pontage. L’automatisation de la préparation des échantillons et l’usage du réactif enrichissable PhoX ont ensuite permis l’analyse de conformations peu abondantes. Une méthode de fractionnement en phase gazeuse basée sur la mobilité ionique FAIMS a été développée, atteignant des performances proches de l’enrichissement en solution. Ces différentes avancées ont été appliquées à l’étude structurale des complexes RuvBL1-RuvBL2 (R1R2) dans un cadre collaboratif international incluant R1R2-SPAG1-PIH1D2, R1R2-SHQ1-DKC1 et R1R2-NONO. Enfin, l’application du XL-MS a été étendue aux protéomes entiers et in-vivo grâce au développement d’un fractionnement automatisé en solution et l’extension de notre approche FAIMS.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2025STRAF012
Type de ressource : Thèse