Caractérisation du génome des écrevisses d'eau douce européennes
Langue Anglais
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Modalités de diffusion de la thèse :
  • Thèse confidentielle jusqu'au 19/05/2026.
  • Thèse avec 2 versions : seule la version intégrale est proposée ; sur authentification (communication intranet).
 
Auteur : Bonassin, Lena
Date de soutenance : 19-11-2025

Directeur(s) de thèse : Lecompte, Odile - Theissinger, Kathrin

Président : Schacherer, Joseph
Rapporteur(s) : Heitkam, Tony - Petrusek, Adam
Membre(s) du jury : Schwenk, Klaus

Établissement de soutenance : Strasbourg - Rheinland-Pfälzische Technische Universität Kaiserslautern-Landau
Laboratoire : Laboratoire des sciences de l'ingénieur, de l'informatique et de l'imagerie (Strasbourg ; 2013-....)
École doctorale : École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Sciences de la vie et de la santé
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie, Animaux. Zoologie

Mots-clés libres : Écrevisses d'eau douce, Éléments répétés, Génomique, Diversité génétique
Mots-clés :
  • Écrevisses - Conservation des ressources
  • Génome
  • Écologie d'eau douce
Résumé : Les écrevisses d'eau douce constituent un groupe de crustacés décapodes important sur le plan écologique, dont de nombreuses espèces sont menacées. Leur conservation est essentielle pour limiter la perte de biodiversité. Les ressources génomiques sont cependant limitées du fait de leurs très grands génomes riches en répétitions. Dans cette étude, je réponds à ce manque de données génomique en caractérisant le génome des familles d'écrevisses d'eau douce. J'ai identifié une grande proportion d'éléments transposables et d'ADN satellite, avec une teneur en ADN satellite élevée chez les espèces à grands génomes. Je propose une procédure optimisée de séquençage à lecture longue qui produit des données de haute qualité, adaptées à l'assemblage de novo, et réduit les difficultés liées au séquençage de génomes complexes. Enfin, j'ai appliqué les données génomiques à la conservation de l’espèce menacée Austropotamobius bihariensis, soulignant la nécessité de préserver sa singularité génétique.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2025STRAJ098
Type de ressource : Thèse