Protéomique : maîtrise de l'instrumentation, applications et étude des glycosylations
Langue Français
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Auteur : Hovasse, Agnès
Date de soutenance : 29-09-2010

Directeur(s) de thèse : Van Dorsselaer, Alain


Établissement de soutenance : Université de Strasbourg
École doctorale : École doctorale Sciences chimiques (Strasbourg ; 1995-....)
 
Discipline : Chimie analytique
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie

Mots-clés libres : stratégies protéomiques , spectrométrie de masse , chromatographie liquide , glycosylations , caractérisation de proteines , quantification
Mots-clés :
  • Technologie des protéines - Thèses et écrits académiques
  • Protéomique - Thèses et écrits académiques
  • Spectroscopie de masse - Thèses et écrits académiques
  • Chromatographie en phase liquide - Thèses et écrits académiques
  • Glycosylation - Thèses et écrits académiques
  • Protéines - Thèses et écrits académiques
Résumé : Pour répondre aux questions posées par les biologistes, la description des protéomes doit être de plus en plus précise au niveau des structures des protéines et en particulier des modifications posttraductionnelles. Malgré le grand nombre de méthodologies développées en analyse protéomique, la description d'un protéome reste souvent encore assez sommaire au vue de sa complexité structurale. La glycosylation apporte aux protéines un degré de complexité qui rend l'analyse des glycoprotéines particulièrement difficile principalement à cause de son hétérogénéité. Nous avons donc développé un ensemble de méthodologies qui permet, non seulement de déterminer les sites de N-glycosylation ainsi que les micro-hétérogénéités associées, mais qui est également adapté à l'étude d'échantillons disponibles en très petites quantités. Notre travail a principalement porté sur les points suivants : · L'identification d'un maximum de protéines grâce à une optimisation des méthodes nanoLCMS/MS pour des d'échantillons en très petites quantités ne permettant de réaliser qu une seule analyse ; · La caractérisation des glycopeptides présents dans des mélanges complexes, en utilisant les ions diagnostiques spécifiques de la fragmentation des glycopeptides. Ces développements méthodologiques ont été appliqués à différents problèmes biologiques (Toxoplasma gondii, Vitis vinifera), et ont ainsi permis d'identifier et de caractériser des protéines et des glycoprotéines impliquées dans des processus biologiques clefs.
 
Type de contenu : Text
 
Entrepôt d'origine : Ressource locale
Identifiant : ecrin-ori-303531
Type de ressource : Thèse