Développement de méthodes d'analyse protéomique et phosphoprotéomique à haut débit et leur application pour la recherche de biomarqueurs de pathologies sur de larges cohortes
Langue Anglais
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Modalités de diffusion de la thèse :
  • Thèse confidentielle jusqu'au 30/03/2025.
  • AccŽs réservé à l'ensemble de la communauté universitaire jusqu'au 30/03/2025 (communication intranet).
 
Auteur : Gebelin, Marie
Date de soutenance : 29-09-2023

Directeur(s) de thèse : Carapito, Christine - Schaeffer-Reiss, Christine

Président : Pineau, Charles
Rapporteur(s) : Pineau, Charles - Hirtz, Christophe
Membre(s) du jury : Pflieger, Delphine

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Institut pluridisciplinaire Hubert Curien (Strasbourg ; 2006-....)
École doctorale : École doctorale des Sciences chimiques (Strasbourg ; 1995-....)
 
Discipline : Chimie analytique
Classification : Chimie, minéralogie, cristallographie

Mots-clés libres : Protéomique, Spectrométrie de masse, Phosphoprotéomique, Acquisition indépendante des données (DIA), Multi-omique
Mots-clés :
  • Protéomique
  • Spectrométrie de masse
Résumé : L’analyse protéomique par spectrométrie de masse permet l’identification, la quantification et la caractérisation structurale des protéines impliquées dans de nombreux processus biologiques. Cette approche peut également être appliquée à l’étude des modifications post-traductionnelles des protéines, telle que la phosphorylation. Ce travail de thèse est axé sur le développement de méthodes analytiques pour l’analyse protéomique et phosphoprotéomique à haut débit. Ces développements ont été réalisés à différents niveaux : la préparation automatisée des échantillons, l’analyse LC-MS/MS avec l’évaluation de différentes méthodes d’acquisition et le traitement des données par diverses solutions algorithmiques. Ils ont ensuite été appliqués pour l’étude de large cohortes d’échantillons cliniques dans le but d’identifier et quantifier de potentiels marqueurs de la sclérose latérale amyotrophique. Enfin, des échantillons et métriques de contrôle qualité ont été implémentés à la fois pour l’analyse protéomique et phosphoprotéomique adaptés à des études de grands nombres d’échantillons.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2023STRAF041
Type de ressource : Thèse