Étude bioinformatique des profils de méthylation de l’ADN et de la liaison des facteurs de transcription dans le cancer
Langue Anglais
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Modalités de diffusion de la thèse :
  • Thèse confidentielle jusqu'au 13/11/2027.
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Auteur : Balaramane, Delphine
Date de soutenance : 13-11-2024

Directeur(s) de thèse : Weber, Michaël - Bardet, Anaïs

Président : Mathelier, Anthony
Membre(s) du jury : Colomé-Tatché, Maria

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Biotechnologie et signalisation cellulaire (Strasbourg ; 2011-....)
École doctorale : École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Bioinformatique
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie, Médecine et santé

Mots-clés libres : Bioinformatique, Épigénétique, Méthylation de l’ADN, Facteurs de transcription, Régulation des gènes
Mots-clés :
  • ADN - Méthylation
  • Facteurs de transcription
  • Cancer - Génétique
Résumé : La méthylation de l'ADN est une modification épigénétique importante qui régule l'expression des gènes et anti-corrèle avec l'accessibilité de la chromatine et la liaison aux facteurs de transcription. Dans le cancer, des profils de méthylation anormaux conduisent à une hyperméthylation, réprimant les gènes suppresseurs de tumeurs, ou à une hypométhylation, activant les oncogènes. Pour mieux comprendre ces altérations, nous avons développé MethyLasso, une méthode pour identifier les régions faiblement méthylées et non méthylées, les vallées non méthylées, les domaines partiellement méthylés dans une condition et les régions différentiellement méthylées entre deux conditions. Ces régions sont des sites régulateurs clés liés par des facteurs tels que des enhancers et des promoteurs. De plus, nous avons conçu une approche intégrant des motifs de facteurs de transcription, l'accessibilité de la chromatine et la méthylation pour étudier la sensibilité des facteurs à la méthylation dans divers cancers. Les résultats obtenus apportent des informations sur la relation complexe entre la méthylation de l'ADN et la liaison aux facteurs de transcription.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2024STRAJ047
Type de ressource : Thèse