Rôles des déadénylases CCR4a et CCR4b dans la modulation de la déadénylation de l'ARNm et son interaction avec l'uridylation chez Arabidopsis thaliana
Langue Anglais
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Auteur : Simonnot, Quentin
Date de soutenance : 05-04-2024

Directeur(s) de thèse : Gagliardi, Dominique

Président : Meignin, Carine
Rapporteur(s) : Ameres, Stefan L. - Deragon, Jean-Marc

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Institut de biologie moléculaire des plantes (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Aspects moléculaire et cellulaires de la biologie
Classification : Plantes. Botanique

Mots-clés libres : Déadénylation, Uridylation, Dégradation des ARNm, Séquençage nanopore, Arabidopsis
Mots-clés :
  • ARN messagers - Détérioration
  • Plantes -- Expression génique
  • ARN messagers - Métabolisme -- Génétique
  • Arabidopsis
Résumé : La déadénylation raccourcit la queue poly(A), tandis que l'uridylation ajoute des uridines en 3' et favorise la dégradation des ARNm déadénylés. Chez Arabidopsis, l'uridylation prévient une déadénylation excessive. Ces mécanismes soulignent une régulation complexe et essentielle du métabolisme des ARNm. Mes travaux de thèse ont précisé les relations moléculaires régissant la déadénylation des ARNm par le complexe CCR4-NOT et leur uridylation par la TUTase URT1. L’analyse des ARNm de plantes KO ccr4a ccr4b a révélé le rôle crucial des déadénylases CCR4-NOT dans le façonnage des queues poly(A), vraisemblablement impliqué lors de la réponse immunitaire et la germination du tube pollinique. L’activité de CCR4-NOT influence le profil d’uridylation des ARNm par URT1, car la diminution de la déadénylation allonge les queues poly(A) uridylées. Inversement, le niveau d’uridylation par URT1 modifie l’ampleur de la déadénylation. Enfin, j'ai identifié l'interaction d'URT1 avec EXA1, une protéine partenaire de CCR4-NOT. Ces résultats précisent les liens entre ces acteurs de la dégradation des ARNm, soulignant leur rôle conjoint dans la définition de l'extrémité 3' des ARNm.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2024STRAJ101
Type de ressource : Thèse