Analyse structurelle et fonctionnelle de la région génomique de vitis rotundifolia contenant le gène Rpv2 de résistance au mildiou de la vigne
Langue Français
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Auteur : Marsan, Laurie
Date de soutenance : 07-03-2025

Directeur(s) de thèse : Mestre, Pedro F.

Président : Lemaire, Olivier
Rapporteur(s) : Faivre Rampant, Patricia - Fudal, Isabelle
Membre(s) du jury : Rustenholz, Camille - Duplessis, Sébastien

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Santé de la vigne et qualité du vin (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Sciences de la vie et de la santé
Classification : Plantes. Botanique, Sciences de la vie, biologie, biochimie

Mots-clés libres : Rpv2, Résistance totale, Vigne, Mildiou, Avirulence, TIR-NBS-LRR
Mots-clés :
  • Vigne - Résistance aux maladies
  • Plasmopara viticola - Lutte contre
  • Mildiou de la vigne - Génétique
Résumé : Plasmopara viticola, oomycète responsable du mildiou de la vigne entraîne des pertes considérables pour la viticulture. Actuellement, la lutte contre cet agent pathogène repose sur les produits phytosanitaires, qui présentent des impacts négatifs sur la santé et l’environnement. Une stratégie alternative est la création variétale, qui consiste à introgresser des facteurs de résistance issus d’espèces américaines ou asiatiques dans des variétés européennes sensibles (Vitis vinifera). V. rotundifolia, une espèce de vigne américaine, est totalement résistante au mildiou grâce, entre autres, au locus Rpv2, localisé sur le chromosome 18, qui induit la résistance aux premiers stades de développement de P. viticola. Grâce à l’analyse d’individus recombinants, nous avons réduit la taille de la région génomique contenant Rpv2. Ensuite, l’annotation fonctionnelle des gènes de cette région, combinée à des analyses d'expression génique et de génomique comparative a permis d’identifier deux gènes candidats appartenant à la famille des TIR-NBS-LRR (TNL). Les protéines TNL activent les mécanismes de défense de la plante au contact d’un facteur moléculaire de l’agent pathogène, appelé Avr. Nous avons débuté les démarches d’identification d’AvrRpv2 utilisant une stratégie d’effectoromique, avec sélection d’effecteurs candidats sur la base de leur cinétique d’expression et de leur prédiction structurelle d’interaction avec les TNL. Même si la nature d’AvrRpv2 reste à élucider, nos travaux ont permis d’identifier trois effecteurs de P. viticola capables d’induire la mort cellulaire à différents niveaux.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2025STRAJ123
Type de ressource : Thèse