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Etude du mécanisme de translocation de l'ARNtLys dans les mitochondries de Saccharomyces cerevisiae
Résumé : L’import d’ARN dans les mitochondries est un processus ubiquitaire chez les eucaryotes. Dans Saccharomyces cerevisiae un isoaccepteur cytosolique de l’ARNtLys, l’ARNtLys(CUU) (tRK1), est partiellement importé dans les mitochondries. L’adressage vers la surface mitochondriale a été étudié en détail ...
Mots clés : ARN de transfert, Cellules eucaryotes, Saccharomyces cerevisiae, Translocation (génétique), Transport des ARN
Auteur : Schirtz Tom
Année de soutenance : 2012
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Etude du mécanisme de translocation de l'ARNtLys dans les mitochondries de Saccharomyces cerevisiae
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Etudes des mécanismes d'adressage d'ARN de transfert dans les mitochondries de levure et humaines
Résumé : Des mutations dans le génome mitochondrial donnent lieu à l’apparition de maladies neuro-dégénératives ou de myopathies. Pour développer des approches de thérapie génique pour prévenir de ces syndromes, nous devons mieux comprendre les mécanismes moléculaires d’import mitochondrial des ARN. Pour ...
Mots clés : Mitochondries, ARN de transfert, Énolase, Traduction génétique
Auteur : Baleva Mariia
Année de soutenance : 2016
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Exploitation des voies d'adressage mitochondrial d'ARN à des fins thérapeutiques
Résumé : Les mitochondries sont des organites possédant leur propre génome qui peut être l’objet de mutations, souvent associées à de graves maladies neuromusculaires. La plupart des mutations de l’ADN mitochondrial (ADNmt) sont hétéroplasmiques, ce qui signifie que les molécules mutantes et sauvages coe ...
Mots clés : Organites, ADN mitochondrial, ADN -- Réplication, Génomique
Auteur : Loutre Romuald
Année de soutenance : 2017
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Génomique des populations : étude comparative au sein du sous-phylum des Saccharomycotina
Résumé : Les améliorations des technologies de séquençage offrent aujourd’hui la possibilité d’explorer la variabilité intraspécifique au sein d’une espèce à travers le séquençage complet du génome d’un grand nombre d’individus. Dans ce contexte, mes travaux de thèse se sont basés sur l’étude et la comparaison ...
Mots clés : Variabilité génétique, Métagénomique, Bioinformatique
Auteur : Gounot Jean-Sébastien
Année de soutenance : 2018
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Import d'ARN dans les mitochondries de cellules humaines : identification à grande échelle et applications thérapeutiques
Résumé : Les mutations dans le génome mitochondrial humain sont souvent associées à de graves maladies neuromusculaires. Mon projet de thèse a consisté tout d’abord au développement d’une stratégie thérapeutique basée sur l’import mitochondrial de molécules d’ARN. J’ai pu démontrer que l’expression stable ...
Mots clés : Mitochondriopathies, Translocation (génétique), ADN mitochondrial, ARN mitochondrial, Génie génétique
Auteur : Jeandard Damien
Année de soutenance : 2019
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Ingénierie d'un outil basé sur une GFP fragmentée pour l'étude des protéines multi-localisées chez les eucaryotes
Résumé : Les aminoacyl-ARNt synthétases catalysent la formation des aminoacyl-ARNt, utilisés lors de la synthèse protéique et peuvent également former des complexes multi-synthétasiques (MSC). Chez S. cerevisiae, le complexe AME associe les glutamyl- et méthionyl-ARNt synthétases à la protéine d’ancrage ...
Mots clés : Aminoacyl-ARNt synthétases, Saccharomyces cerevisiae, Mitochondries
Auteur : Bader Gaëtan
Année de soutenance : 2017
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Ingénierie d'un outil basé sur une GFP fragmentée pour l'étude des protéines multi-localisées chez les eucaryotes
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Investigations of the bacterial sink for plant emissions of chloromethane
Résumé : Le chlorométhane est le plus abondant des composés organo-halogénés dans l’atmosphère et il est impliqué dans la destruction de l’ozone dans la stratosphère. Les sources et les puits de chlorométhane restent mal évalués. Bien que synthétisé et utilisé de manière industrielle, il est principalement ...
Mots clés : Bactéries méthylotrophes, Chlorométhane, Écologie végétale, Génomique comparative
Auteur : Farhan Ul Haque Muhammad
Année de soutenance : 2013
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Le complexe multisysthématique AME de levure : dynamique de l'édifice et rôles non canoniques de ces composants
Résumé : Les complexes multisynthétasiques (MSC) sont des complexes multi-protéiques identifiés dans un grand nombre d’organismes pro- et eucaryotes. Ils impliquent des protéines d’assemblages et des aminoacyl-ARNt synthétases (aaRSs), responsables de l’aminoacylation de leurs ARNts homologues au cours de ...
Mots clés : Traduction génétique, ARN de transfert, Aminoacyl-ARNt synthétases, Cellules eucaryotes, Mitochondries, Saccharomyces cerevisiae
Auteur : Enkler Ludovic
Année de soutenance : 2014
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Le rôle des bactéries dans le filtrage du chlorométhane un gaz destructeur de la couche d'ozone : des souches modèles aux communautés microbiennes de sols forestiers
Résumé : Le chlorométhane (CH3Cl) est un composé organique volatile responsable de plus de 15 % de la dégradation de l’ozone stratosphérique due aux composés chlorés. Il est produit majoritairement par les plantes vivantes ou en décomposition. Les bactéries capables d’utiliser le CH3Cl comme source de carbone ...
Mots clés : Écologie microbienne, Bactéries méthylotrophes, Séquençage des acides nucléiques, Chlorométhane, Sols forestiers
Auteur : Chaignaud Pauline
Année de soutenance : 2016
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Mécanismes adaptatifs et interactions métaboliques au sein de communautés microbiennes soumises au stress arsénié
Résumé : L’arsenic est naturellement présent dans la croûte terrestre et de manière abondante dans certains environnements. Si cet élément est toxique pour la plupart des formes de vies, des micro-organismes développent différents mécanismes pour y faire face. Ce travail porte sur l’étude de ces processus ...
Mots clés : Arsenic -- Composés, Bactéries -- Métabolisme, Protistes eucaryotes, Génétique microbienne, Intoxication par l'arsenic, Métagénomique
Auteur : Andres Jérémy
Année de soutenance : 2014
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Microbial degradation of dichloromethane in aquifers : diversity, community dynamics and stability of the function in response to changes in physicochemical parameters
Résumé : Le dichlorométhane (DCM, CH2Cl2) est un solvant industriel persistant et toxique fréquemment détecté dans les eaux souterraines. Cette étude examine l’influence du contenu en eau, du statut oxique et de la granulométrie sur l’activité et la composition des communautés DCM-dégradantes. Les résultats ...
Mots clés : Dichlorométhane, Aquifères, Cultures microbiennes, Eaux souterraines -- Pollution
Auteur : Lázaro Sánchez Carmen
Année de soutenance : 2024
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Mise au point d'aptamères aux capacités thérapeutiques basés sur les ARN importables dans les mitochondries humaines
Résumé : Les défauts de génome mitochondrial provoquent des maladies neuromusculaires, pour lequel aucun traitement efficace n'a été mis au point. La plupart des mutations mitochondriales sont hétéroplasmique, ce qui signifie que l'ADN mitochondrial (ADNmt) de type sauvage et muté coexistent dans la même ...
Mots clés : Mitochondriopathies, ADN mitochondrial, ADN -- Réplication, Épissage (génétique), Aptamères
Auteur : Dovydenko Ilya
Année de soutenance : 2015
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Multiplicité des origines génétiques de l’isolement reproductif au sein de populations naturelles de levures
Résumé : Un objectif central en biologie est de comprendre la relation entre le génotype et le phénotype. Mes travaux de thèse s’inscrivent dans cette thématique et focalisent sur les populations naturelles d’une même espèce, en utilisant la levure Saccharomyces cerevisiae comme système d’étude. Dans un ...
Mots clés : Saccharomyces cerevisiae, Génétique du développement, Génomique, Isolement reproductif
Auteur : Hou Jing
Année de soutenance : 2016
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Origines génétiques de la variation de tolérance au stress au sein de populations naturelles de levures
Résumé : Une question centrale de la génétique moderne est de mieux comprendre comment la variation génétique présente au sein d’individus d’une même espèce influence la diversité phénotypique et l’évolution. La levure modèle Saccharomyces cerevisiae offre une occasion unique d’apporter des éléments de réponse ...
Mots clés : Saccharomyces cerevisiae, Variabilité génétique, Phénotype, Génotype, Résistance au stress
Auteur : Sigwalt Anastasie
Année de soutenance : 2016
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Pathogenic mutations of the mitochondrial protein ND5 : the development of novel gene therapy strategies
Résumé : Les cellules humaines contiennent multiples copies d'ADNmt, qui code 37 gènes. L'ADNmt est sujet à des mutations qui peuvent conduire à des maladies affectant gravement les tissus ayant des besoins énergétiques élevés. Nous nous sommes concentrés sur deux mutations pathogènes du gène MT-ND5, 13513GA et 13514AG, qui altèrent Asp393, un résidu essentiel à la translocation des protons lors de la synthèse de l'ATP. Notre objectif était d'évaluer si la technologie CRISPR/Cas12a peut être appliquée à l'ADNmt humain. Nous avons démontré que les crRNA chimiquement modifiés améliorent la spécificité ...
Mots clés : ADN mitochondrial, Mutation (biologie), Translocation (génétique)
Auteur : Shebanov Nikita
Année de soutenance : 2024
Accès restreint jusqu'au 01-01-2027 (confidentialité ou accès intranet)    Accès restreint jusqu'au 01-01-2027 (confidentialité ou accès intranet)
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Polyploid phasing algorithms and applications
Résumé : La polyploïdie est répandue dans le monde vivant mais reste peu explorée. Nous avons développé nPhase, une méthode de phasage ploïdie agnostique basée sur l'alignement que nous avons ensuite appliqué à deux populations de levures. Saccharomyces cerevisiae est une levure utilisée pour brasser de ...
Mots clés : Polyploïdie, Saccharomyces cerevisiae, Génétique des populations
Auteur : Abou Saada Omar
Année de soutenance : 2021
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Régulation in labo et in situ de l'expression de génomes de souches bactériennes méthylotrophes dégradant le dichlorométhane
Résumé : Le dichlorométhane (DCM ; CH2Cl2) est un polluant chloré toxique émis dans l’environnement principalement par les activités industrielles. Ce polluant peut être dégradé par des bactéries méthylotrophes qui utilisent des composés en C1 réduits comme seule source de carbone et d’énergie. La protéo ...
Mots clés : Bactéries méthylotrophes, Facteurs de transcription, Génomique, Biotransformation (métabolisme), Dichlorométhane, Methylobacterium extorquens
Auteur : Maucourt Bruno
Année de soutenance : 2019
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Species-wide exploration of the complexity, expressivity, and missing heritability of traits
Résumé : La diversité phénotypique des populations naturelles est contrôlée par une base génétique complexe. Les technologies de séquençage nous permettent d’analyser les génotypes de grandes populations qui peuvent être utilisés pour disséquer la relation génotype-phénotype. Ceci est souvent fait en étudiant ...
Mots clés : Génétique quantitative, Étude d'association pangénomique, Variabilité, Expression génique
Auteur : Tsouris Andreas
Année de soutenance : 2023
Restriction d'accès permanente : confidentialité ou accès intranet uniquement    Restriction d'accès permanente : confidentialité ou accès intranet uniquement
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Species-wide exploration of the complexity, expressivity, and missing heritability of traits
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Species-wide survey of transcript and protein abundance variation in yeast
Résumé : Une importante diversité phénotypique peut être observée au sein des populations naturelles. L'un des principaux objectifs de la biologie moderne est d'élucider les origines génétiques de cette diversité. L'expression des gènes est l’un des principaux acteurs de la relation entre les génotypes et ...
Mots clés : Transcription génétique, Saccharomyces cerevisiae, ARN -- Modifications posttranscriptionnelles
Auteur : Teyssonnière Élie
Année de soutenance : 2023
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Species-wide survey of transcript and protein abundance variation in yeast
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Structure, diversité et dynamique des communautés microbiennes impliquées dans la fermentation du kombucha
Résumé : Elucider les interactions entre les espèces d’une niche écologique est une thématique majeure en biologie. Grâce aux avancées technologiques des méthodes de séquençage haut débit, cette thématique connait un essor considérable dans le contexte des communautés microbiennes. Elles permettent d’ide ...
Mots clés : Fermentation, Kombucha, Métagénomique
Auteur : Ben Saâd Emna
Année de soutenance : 2022
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Structure, diversité et dynamique des communautés microbiennes impliquées dans la fermentation du kombucha
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