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École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
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Structural differences and specificities of mRNA translation initiation complexes between trypanosomes and their hosts
Description
:
Les kinétoplastides sont un groupe de protozoaires flagellés dont quelques espèces parasites exclusives causent des maladies menaçant plusieurs millions de personnes à travers le monde. Etant des espèces eucaryotes parasitant d’autres espèces eucaryotes comme les mammifères, il existe une forte ...
Mots clés
:
Protozoaires pathogènes, Trypanosoma, Relations hôte-virus, Traduction génétique
Auteur
:
Bochler Anthony
Année de soutenance
:
2020
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Structural differences and specificities of mRNA translation initiation complexes between trypanosomes and their hosts
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Structural investigations of the protein synthesis apparatus of Candida albicans studied by cryo-EM
Description
:
La plupart des infections causées par Candida albicans - l'agent pathogène fongique le plus courant - sont associées à des traitements très toxiques et coûteux. Le principal défi aujourd'hui est de trouver les inhibiteurs spécifiques qui agissent uniquement contre la cible choisie, comme le ribosome ...
Mots clés
:
Synthèse protéique, Candida albicans, Antifongiques
Auteur
:
Zgadzay Yuri
Année de soutenance
:
2022
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Structural investigations of the protein synthesis apparatus of Candida albicans studied by cryo-EM
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Structural rearrangements of the HIV-1 genomic RNA during maturation of the viral particle
Description
:
Le VIH-1 bourgeonne sous forme immature et doit subir l’étape de maturation afin d’acquérir son caractère infectieux. La maturation protéolytique du précurseur Pr55Gag induit le réarrangement morphologique de la particule alors que le dimère d’ARNg acquiert une compaction optimale. Ces réarrangements ...
Mots clés
:
Infections à VIH, Épissage (génétique), Génomique, ARN viral, Molécules chaperonnes
Auteur
:
Mailler Élodie
Année de soutenance
:
2017
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Structural rearrangements of the HIV-1 genomic RNA during maturation of the viral particle
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Structural studies of the cytoplasmic dyneins and the BicD2 cargo adaptor
Description
:
Les dynéines cytoplasmiques dirigent la majorité des événements de transport rétrograde des microtubules dans les cellules eucaryotes. La dynéine cytoplasmique-1 est impliquée dans la division cellulaire, le transport des organelles et des vésicules, le développement du cerveau et des muscles, tandis ...
Mots clés
:
Dynéine, Transport biologique, Microtubules
Auteur
:
Fagiewicz Robert
Année de soutenance
:
2022
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Structural studies of the cytoplasmic dyneins and the BicD2 cargo adaptor
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Structural studies of the Staphylococcus aureus ribosome
Description
:
Le ribosome est une machinerie cellulaire importante impliquée dans la synthèse protéique de toute cellule vivante. Par conséquent, le ribosome est l'une des principales cibles des antibiotiques naturels, qui sont capables de tuer les cellules bactériennes en bloquant la synthèse protéique. Toutefois, ...
Mots clés
:
Ribosomes, Cryomicroscopie, Infections à staphylocoque doré, Cristallographie
Auteur
:
Khusainov Iskander
Année de soutenance
:
2015
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Structural studies of the Staphylococcus aureus ribosome
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Structural studies on RNA polymerase elongation complexes interacting with other cellular machines
Description
:
Afin de surmonter les effets inhibiteurs d'un enroulement excessif du brin d'ADN dû à la transcription, l'ARN polymérase (ARNP) collabore avec les ADN topoisomérases. Des interactions directes entre la RNAP et la topoisomérase I (TopoI) avaient été suggérées sans que les détails moléculaires de ...
Mots clés
:
Topoisomérases, Élongation (biologie moléculaire), Interactions ADN-protéine
Auteur
:
Vidmar Vita
Année de soutenance
:
2023
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Structural studies on RNA polymerase elongation complexes interacting with other cellular machines
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Structural study of mRNA translation in kinetoplastids by Cryo-electron microscopy
Description
:
Les kinétoplastides sont un groupe de protozoaires, et qui menace plus de 400 millions de personnes dans le monde entier. Ils possèdent des segments d'expansion d'ARNr (SE) inhabituellement plus larges dans les sous-unités 40S. Ici, nous avons purifié à partir de lysats de cellules de T. cruzi ...
Mots clés
:
Cryomicroscopie, Traduction génétique, ARN ribosomique
Auteur
:
Brito Querido Jailson Fernando
Année de soutenance
:
2017
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Structural study of mRNA translation in kinetoplastids by Cryo-electron microscopy
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Structural study of the SWI/SNF chromatin remodeler
Description
:
Le complexe SWI/SNF est une machine moléculaire capable de remodeler la structure de la chromatine dont le mécanisme d’action reste encore mal compris. Il est aussi impliqué dans l'intégration du génome viral du VIH ainsi que dans le cancer, où le complexe est muté dans 20 % des cancers humains. ...
Mots clés
:
Chromatine, Cancer, Épigénétique
Auteur
:
Werderer Maximilien
Année de soutenance
:
2023
Accès restreint jusqu'au 15-05-2025 (confidentialité ou accès intranet)
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Structural study of the SWI/SNF chromatin remodeler
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Structural study of the transcriptional co-activator SAGA
Description
:
Le complexe SAGA (Spt-Ada-Gcn5 acetyl transferase) est un co-activateur transcriptionel, conservé chez les eucaryotes, qui participent à la transcription d’environ 10% des gènes chez la levure, où il fait le lien entre les composants du complexe de pré-initiation, tel que la TATA-box Binding Protein ...
Mots clés
:
Facteurs de transcription, Transcription génétique, Saccharomyces cerevisiae, Ubiquitination
Auteur
:
Durand Alexandre
Année de soutenance
:
2014
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Structural study of the transcriptional co-activator SAGA
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Structure and dynamics of the penguin synnomes : understanding seabird life history and response to climate change through population genomics
Description
:
L’Océan austral est l’un des pivot des écosystèmes et du climat de notre planète, qui concentre plus de 20% de la productivité primaire marine mondiale. La complexité de ses réseaux trophiques et son inaccessibilité rendent plus encore qu’ailleurs nécessaire l’utilisation d’espèces bio-indicatrices. ...
Mots clés
:
Métagénomique, Manchots (oiseaux), Bioclimatologie, Changements climatiques -- Adaptation
Auteur
:
Cristofari Robin
Année de soutenance
:
2016
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Structure and dynamics of the penguin synnomes : understanding seabird life history and response to climate change through population genomics
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Structure and evolution of animal mitochondrial tRNAs
Description
:
Les approches bioinformatiques développées au cours de cette thèse ont permis d’une part le développement de banques de données concernant les ARNt classiques ainsi que les ARNt mitochondriaux de métazoaires. Celles-ci sont basées sur de nouveaux outils pour la détection de gènes d’ARNt «bizarres» ...
Mots clés
:
ARN de transfert, Métazoaires, Mitochondries, Bases de données d'acides nucléiques
Auteur
:
Jühling Frank
Année de soutenance
:
2013
Restriction d'accès permanente : confidentialité ou accès intranet uniquement
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Structure and evolution of animal mitochondrial tRNAs
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Structure and function of the C9ORF72-SMCR8-WDR41 complex and its implication for Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS)
Description
:
La sclérose latérale amyotrophique (SLA ou maladie de Charcot) est la troisième maladie neurodégénérative la plus répandue. La principale cause génétique de la SLA est une expansion de répétitions GGGGCC dans le gène C9ORF72, dont la protéine forme un complexe avec les protéines SMCR8 et WDR41. ...
Mots clés
:
Sclérose latérale amyotrophique, Lysosomes, Protéine C9orf72
Auteur
:
Pietri David
Année de soutenance
:
2023
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Structure and function of the C9ORF72-SMCR8-WDR41 complex and its implication for Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS)
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Structure de l'ARN au sein des ribonucléoprotéines des Influenzavirus A
Description
:
Le génome des Influenzavirus A est constitué de huit segments d’ARN de polarité négative formant des ribonucléoprotéines virales (RNPv). La segmentation du génome complique l’empaquetage du génome, puisqu’un jeu complet de segments est nécessaire à l’infectiosité des virus. Il est aujourd’hui admis ...
Mots clés
:
Influenzavirus A, Nucléoprotéines, Molécules chaperonnes, Protéines virales, Interactions ARN-protéine
Auteur
:
Ferhadian Damien
Année de soutenance
:
2018
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Structure de l'ARN au sein des ribonucléoprotéines des Influenzavirus A
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Structure, diversité et dynamique des communautés microbiennes impliquées dans la fermentation du kombucha
Description
:
Elucider les interactions entre les espèces d’une niche écologique est une thématique majeure en biologie. Grâce aux avancées technologiques des méthodes de séquençage haut débit, cette thématique connait un essor considérable dans le contexte des communautés microbiennes. Elles permettent d’ide ...
Mots clés
:
Fermentation, Kombucha, Métagénomique
Auteur
:
Ben Saâd Emna
Année de soutenance
:
2022
Accès restreint jusqu'au 16-12-2024 (confidentialité ou accès intranet)
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Structure, diversité et dynamique des communautés microbiennes impliquées dans la fermentation du kombucha
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Structure, fonction et inhibition du ribosome de Candida albicans
Description
:
Candida albicans est un champignon polymorphe, membre de la flore normale humaine, où il réside comme un organisme commensal tout au long de la vie. Cependant, dans certaines circonstances il peut causer des mycoses qui vont des infections superficielles de la peau à des infections systémiques m ...
Mots clés
:
Ribosomes, Traduction génétique, Bioinformatique structurale, Radiocristallographie, Protéines ribosomiques
Auteur
:
Bruchlen David
Année de soutenance
:
2016
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Structure, fonction et inhibition du ribosome de Candida albicans
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Structure-function analysis of the key cell cycle regulator CDKB2 in Arabidopsis
Description
:
Le cycle cellulaire est fermement contrôlé par l’activité de kinases cycline dépendantes (CDKs). Les CDKs d’Arabidopsis, plante à fleur, ont été classées en six types, parmi lesquels les CDKs de type A- et B- sont les acteurs pajeurs du cycle cellulaire végétal. Les CDKs de type B sont spécifiques aux ...
Mots clés
:
Cycle cellulaire végétal, Enzymes végétales, Arabidopsis thaliana, Kinases dépendantes des cyclines
Auteur
:
Azeem Muhammad
Année de soutenance
:
2012
Restriction d'accès permanente : confidentialité ou accès intranet uniquement
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Structure-function analysis of the key cell cycle regulator CDKB2 in Arabidopsis
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Structure-function studies of human ribosome complexes
Description
:
L’architecture et la régulation de la traduction eucaryote fut pendant longtemps un mystère pour les biologistes. Je présente ici un protocole détaillé pour purifier de manière homogène des ribosomes à partir de cellules HeLa, pour des études biochimiques mais également structurales. En utilisant ...
Mots clés
:
Ribosomes, Synthèse protéique, Génétique moléculaire humaine, Expression génique
Auteur
:
Khatter Heena
Année de soutenance
:
2014
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Structure-function studies of human ribosome complexes
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Structure-function studies of the vitamin D nuclear receptor complex with the coactivator MED1
Description
:
Le récepteur de la vitamine D (VDR) est un facteur de transcription activé par la forme active de la vitamine D3. VDR est une cible thérapeutique potentielle pour de multiples pathologies telles que les maladies auto-immunes et neurodégénératives et certains cancers. VDR module l’expression de gènes ...
Mots clés
:
Vitamines D, Transcription génétique, Complexes récepteur-ligand, Relations structure-activité, Activation de la transcription
Auteur
:
Belorusova Anna
Année de soutenance
:
2015
Restriction d'accès permanente : confidentialité ou accès intranet uniquement
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Structure-function studies of the vitamin D nuclear receptor complex with the coactivator MED1
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Structure-function study of the human ribosome by cryo electron microscopy
Description
:
Le ribosome est une machinerie moléculaire qui passe par différentes phases : initiation, élongation et terminaison de la traduction de l'ARN messager. La synthèse des protéines est catalysée par le ribosome et régulée par des facteurs protéiques qui se lient transitoirement au ribosome au cours ...
Mots clés
:
Ribosomes, Synthèse protéique, Interactions ARN-ligand
Auteur
:
Fréchin Léo
Année de soutenance
:
2022
Accès restreint jusqu'au 31-12-2024 (confidentialité ou accès intranet)
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Structure-function study of the human ribosome by cryo electron microscopy
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Structures et fonctions du domaine C-Terminal de l'intégrase du VIH-1
Description
:
L’Integrase du VIH est une ADN recombinase catalysant deux réactions qui permettent l'intégration de l'ADN viral dans l'ADN hôte. L’intégrase du VIH comprend 3 domaines : N-terminal impliqué dans la réaction de « 3' processing » et le transfert de brin, le domaine catalytique contenant le site actif ...
Mots clés
:
Intégrase du VIH, Protéines virales, Multimérisation de protéines
Auteur
:
Oladosu Oyindamola
Année de soutenance
:
2017
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Structures et fonctions du domaine C-Terminal de l'intégrase du VIH-1
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