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Epigénétique et méthylation de l'ADN : étude des mécanismes d'interaction du domaine SRA de UHRF1 avec l'ADN hémi-méthylé
Description : La protéine UHRF1 est impliquée dans le maintien et la transmission des modifications épigénétiques. Lors du processus de réplication, elle recrute la méthyltransférase de l’ADN Dnmt1 au niveau des sites CpG hémi-méthylés via son domaine SRA (SET and RING Associated), favorisant la duplication des ...
Mots clés : Épigénétique, ADN, Séquençage des acides nucléiques, Interactions ADN-protéine, Spectroscopie de fluorescence
Auteur : Greiner Vanille
Année de soutenance : 2012
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Epigénétique et méthylation de l'ADN : étude des mécanismes d'interaction du domaine SRA de UHRF1 avec l'ADN hémi-méthylé
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Établir un modèle de drosophile pour étudier les défenses immunitaires contre l'injection de cellules cancéreuses RASV12-GFP
Description : Il y a eu des rapports récents sur la réponse antitumorale chez la drosophile. Notre objectif est d'examiner le rôle des signaux immunitaires innés contre les tumeurs RasV12-­GFP chez les mouches adultes. J'ai créé un modèle de tumeur chez les drosophiles adultes en transplantant la lignée de cellules ...
Mots clés : Cellules cancéreuses, Résistance aux maladies, Anticorps antitumoraux
Auteur : Roychowdhury Arghyashree
Année de soutenance : 2018
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Établir un modèle de drosophile pour étudier les défenses immunitaires contre l'injection de cellules cancéreuses RASV12-GFP
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Ethologie et rythmes biologiques du chat
Description : Les rythmes biologiques aident les organismes vivants à programmer la plupart des processus comportementaux dans la fenêtre temporelle la plus appropriée. Les données de la littérature sur la rythmicité du chat domestique sont rares et conflictuelles. Pour approfondir nos connaissances sur le sujet, ...
Mots clés : Comportement animal, Chat domestique, Comportement alimentaire, Rythmes circadiens
Auteur : Parker Marine
Année de soutenance : 2018
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Etude anatomique de l'amygdale étendue centrale chez la souris : connectivité générale et circuits cellule-spécifiques ; implications fonctionnelles dans la douleur
Description : L'amygdale centrale (EAc) est un macrosystème du cerveau antérieur qui joue un rôle important dans la peur, l'anxiété et la douleur. Les deux composants clés, le noyau latéral du lit de la strie terminale (STL) et l’amygdale centrale (CeA), possèdent des caractéristiques neurochimiques, hodologiques ...
Mots clés : Corps amygdaloïde, Protéine kinase C, Noyau central de l'amygdale
Auteur : Ye Jiahao
Année de soutenance : 2018
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Etude biochimique, biophysique et structurale du mécanisme d'action et de l'inhibition sélective de l'histone désacétylase HDAC8
Description : Les histones désacétylases (HDACs) sont les principales cibles des médicaments épigénétiques anticancéreux actuellement approuvés par la FDA. Les HDACs jouent aussi un rôle important dans l'homéostasie des pathogènes eucaryotes. Par conséquent, une stratégie pour lutter contre les maladies négligées ...
Mots clés : Histone désacétylase, Épigénétique, Cancer, Schistosoma mansoni, Cohésine
Auteur : Shaik Tajith Baba
Année de soutenance : 2017
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Etude biochimique comparative des "Actin Depolymerizing Factors"(ADFs) d'Arabidopsis : activité inattendue de pontage des filaments d'actine pour les ADFs appartenant à la sous-classe III
Description : L'organisation et la dynamique du cytosquelette d'actine sont finement régulées par une multitude de "actin-binding proteins" (ABPs). Parmi ces dernières, les ADFs (actin-depolymerizing factors) jouent un rôle majeur dans le turnover des filaments d'actine en induisant leur découpage et en facilitant ...
Mots clés : Actine, Arabidopsis, Protéines du cytosquelette, Élongation (biologie moléculaire), Plantes -- Phosphorylation
Auteur : Tholl Stéphane
Année de soutenance : 2012
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Etude biochimique et structurale des complexes MARS de plasmodium
Description : Plasmodium est le parasite qui cause le paludisme. L’équipe a mis en évidence, in vitro, l’import d’ARNt exogène et a identifié un transporteur potentiel : la protéine tRip (tRNA import protein). In vitro, tRip lie tous les ARNt en reconnaissant leur structure. In vivo, tRip est une protéine tra ...
Mots clés : Plasmodies, Aminoacyl-ARNt synthétases, Paludisme
Auteur : Jaramillo Ponce José Refugio
Année de soutenance : 2020
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Etude biochimique et structurale des complexes MARS de plasmodium
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Etude biochimique, structurale et fonctionnelle du complexe chaperonne d'histone/facteur d'élongation Spt6/Iws1
Description : Les ARN messagers (ARNm) fonctionnels sont produits au cours d'un mécanisme complexe qui allie la transcription, qui permet la synthèse d'un pré-ARNm, la maturation de ce transcrit et son export. De plus, ces différentes machineries vont devoir faire face à la structure compacte de la chromatine, ...
Mots clés : Histones, Molécules chaperonnes, Synthèse protéique, ARN polymérases, Épigénétique
Auteur : Diebold Marie-Laure
Année de soutenance : 2012
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Étude d’éléments cis-régulateurs de l’initiation de la traduction eucaryote par des méthodes in vitro et par des méthodes de criblage à haut-débit
Description : Le premier volet de ce travail est dédié à la recherche de séquences qui modulent la reconnaissance du codon initiateur par le ribosome. L’analyse des résultats de criblages de banques d’ARN rapporteurs portant des contextes nucléotidiques randomisés autour du codon AUG initiateur, ainsi que l’a ...
Mots clés : Codons, Traduction génétique, Séquence nucléotidique
Auteur : Tidu Antonin
Année de soutenance : 2023
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Etude d'un nouveau type de RNase P spécifique des eucaryotes chez Arabidopsis thaliana
Description : La RNase P est impliquée dans la maturation des ARNt en libérant l’extrémité 5’ leader des précurseurs d’ARNt. Jusqu’à récemment, il était admis que cette enzyme soit universellement conservée en tant que complexe ribonucléoprotéique. La rupture avec le modèle établi est venue avec l’identification ...
Mots clés : Épissage (génétique), ARN de transfert, Ribonucléases, Arabidopsis thaliana, Organites végétaux
Auteur : Gutmann Bernard
Année de soutenance : 2012
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Étude de effets non-visuels de la lumière : du sujet sain au spectre des hypersomnies centrales en passant par l’insomnie
Description : La physiopathologie des hypersomnies et insomnies reste mal comprise, ces troubles regroupant des entités mal caractérisées en l’absence de biomarqueurs spécifiques. La lumière étant un régulateur majeur de la veille et du sommeil, l’objectif de cette thèse était d’étudier les effets non-visuels ...
Mots clés : Rythmes circadiens, Troubles du sommeil, Photobiologie
Auteur : Rach Héloïse
Année de soutenance : 2023
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Etude de l'épissage alternatif de l'ARN 35S du virus de la mosaïque du chou-fleur (CaMV) et de l'export nucléaire des ARN viraux
Description : L’épissage alternatif et l’export nucléaire de l’ARN pré-génomique 35S du virus de la mosaïque du chou-fleur (CaMV) ont fait l’objet de peu d’études. Quatre isoformes épissées de l’ARN 35S ont déjà été décrites. Nos résultats montrent que l’épissage alternatif est plus complexe vu que plus d’une ...
Mots clés : Épissage alternatif, Génétique virale, Mosaïques (phytopathologie), Relations hôte-virus, Caulimovirus, Signaux d'export nucléaire
Auteur : Bouton Clément
Année de soutenance : 2014
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Étude de l'export nucléaire des ARNm du virus de la mosaïque du chou-fleur (CaMV) chez Arabidopsis thaliana
Description : Chez les métazoaires et leurs virus la majorité des ARNm est exportée du noyau par les exportines TAP-p15 et le complexe TREX-1, alors qu’une minorité est exportée par CRM1. Chez les plantes ce processus fondamental reste peu décrit voir inconnu pour les phytovirus comme le CaMV et ses ARNm 19S ...
Mots clés : Phytovirus, Transport biologique, Relations hôte-virus, Interactions ARN-protéine, Arabidopsis thaliana, Caulimovirus
Auteur : Kubina Julie
Année de soutenance : 2019
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Etude de l’implication des deux voies de biosynthèse des isoprénoïdes pour la spécificité et la régulation de la prénylation des protéines chez les plantes
Description : La prénylation de type I des protéines correspond à une modification post-traductionnelle faisant intervenir une liaison thioéther entre une cystéine localisée dans un motif CaaX en position C terminale et un groupement prényle en C 15 (farnésyle) ou C 20 (géranylgéranyle). Ces réactions sont ca ...
Mots clés : Transcription génétique, Nicotiana tabaccum, Agents anti-infectieux, Isoprénoïdes, Prénylation des protéines
Auteur : Huchelmann Alexandre
Année de soutenance : 2013
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Étude de l’implication des voies liées à la neuroinflammation dans le comportement d’auto-administration de cocaïne chez le rat
Description : Il est établi depuis plusieurs années que la consommation de cocaïne est à l’origine de nombreuses adaptations cérébrales. En particulier, l'exposition à la cocaïne augmente l’expression de plusieurs marqueurs neuroinflammatoires. Mon travail de thèse, basé sur l’utilisation d’un modèle d’auto-a ...
Mots clés : Facteur de transcription NF-κB, Neuro-inflammation, Cocaïne
Auteur : Correia Caroline
Année de soutenance : 2021
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Etude de l'interactome ARN-ARN chez Staphylococcus aureus : caractérisation, fonction et impact sur les réseaux de régulation
Description : Mon projet de thèse a été de caractériser la fonction de deux sARN, appelés RsaG et RsaI de Staphylococcus aureus, un pathogène opportuniste de l’homme. RsaG est dérivé de la région 3’ non traduite de l’ARNm uhpT, codant pour un transporteur du glucose-6-phosphate, une source de carbone majeur. ...
Mots clés : Staphylocoque doré, Ligands (biochimie) -- Fixation, Aptamères nucléotidiques, Séquences d'acides nucléiques régulatrices
Auteur : Desgranges Emma
Année de soutenance : 2020
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Etude de l'interactome ARN-ARN chez Staphylococcus aureus : caractérisation, fonction et impact sur les réseaux de régulation
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Étude de la biogenèse et des fonctions des petits ARN non codants dérivant d'ARN de transfert chez Arabidopsis thaliana
Description : Les petits ARN non codants dérivant des ARN de transfert (tRFs) ont été identifiés dans tous les domaines de la vie et sont impliqués dans des mécanismes biologiques variés. Mon travail de thèse, mené sur la plante modèle Arabidopsis thaliana, a eu pour but de mieux comprendre la biogenèse des tRFs ...
Mots clés : ARN de transfert, ARN non codants, Arabidopsis thaliana
Auteur : Chery Marjorie
Année de soutenance : 2022
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Étude de la biosynthèse de la cutine chez les bryophytes, un apport à la compréhension de l’évolution des polymères apoplastiques hydrophobes des plantes
Description : Il y a environ 500 millions d’années, une lignée de plantes aquatiques a commencé à coloniser les espaces terrestres. Cet événement évolutif, appelé terrestrialisation, est à l’origine de l’émergence et de la diversification des plantes terrestres, ainsi que d’une profonde modification des cycles ...
Mots clés : Biosynthèse, Polymères végétaux, Bryophytes
Auteur : Knosp Samuel
Année de soutenance : 2022
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Étude de la biosynthèse de la cutine chez les bryophytes, un apport à la compréhension de l’évolution des polymères apoplastiques hydrophobes des plantes
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Etude de la dynamique spatiotemporelle des interactions VHC-récepteurs
Description : Pour infecter les hépatocytes le virus de l'hépatite C (VHC) interagit avec de nombreux facteurs d’entrées et la dynamique d’interaction du VHC avec ces récepteurs lui permettra d’entrer dans la cellule. Parmi eux, Claudin 1 (CLDN1) et Occludin (OCLN), des protéines majeures composant les jonctions ...
Mots clés : Virus de l'hépatite C, Relations hôte-virus, Jonctions cellulaires, Dynamique moléculaire, Génomique
Auteur : Clement Camille
Année de soutenance : 2019
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Etude de la dynamique spatiotemporelle des interactions VHC-récepteurs
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Etude de la dynamique structurale du domaine de liaison au ligand de RXRα et implication de la phosphorylation dans la transcription
Description : De nombreuses études révèlent que le domaine de liaison au ligand de RXRα est très dynamique, même en présence d'un ligand agoniste. Nous avons utilisé les données expérimentales (HDX, RMN et X-ray) disponibles sur ce domaine pour mettre en place un protocole, basé sur la dynamique moléculaire a ...
Mots clés : Complexes récepteur-ligand, Transcription génétique, Analyse conformationnelle, Phosphorylation, Rétinoïdes, Récepteur des rétinoïdes X type alpha
Auteur : Eberhardt Jérôme
Année de soutenance : 2016
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Etude de la dynamique structurale du domaine de liaison au ligand de RXRα et implication de la phosphorylation dans la transcription
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