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A new pathway for bacterial growth with chloromethane
Description : Le chlorométhane (CH3Cl), un produit d'origine essentiellement naturelle, est responsable pour une part importante de la destruction de l'ozone stratosphérique. Certains micro-organismes sont capables de dégrader le CH3Cl, et impactent de manière significative la concentration de ce composé dans ...
Mots clés : Chlorométhane, Bacteries -- Croissance, Génétique bactérienne
Auteur : Luo Jing
Année de soutenance : 2021
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A new pathway for bacterial growth with chloromethane
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Adaptations à la déshalogénation et à l’utilisation du chlorométhane par la voie cmu chez Methylobacterium extorquens
Description : Le chlorométhane (CH3Cl), un gaz organohalogéné principalement d’origine naturelle impliqué dans la dégradation de l’ozone dans l'atmosphère, est dégradé par des bactéries méthylotrophes capables d’utiliser des composés sans liaisons carbone-carbone tels que le méthanol comme seule source de carbone ...
Mots clés : Bactéries méthylotrophes, Déshalogénation, Chlorométhane
Auteur : Mey Louis-François
Année de soutenance : 2023
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Adressage de l'ARN ribosomique 5S dans les mitochondries humaines et la traduction mitochondriale
Description : L’ARNr 5S est une petite molécule d'ARN codée par le noyau, qui est partiellement adressée dans les mitochondries dans les cellules humaines. Bien que le mécanisme d'importation a été étudié, la fonction de ce phénomène est mal comprise. Les données publiées suggèrent que l’ARNr 5S importé pourrait ...
Mots clés : ARN ribosomiques, Synthèse protéique, Mitochondries, Traduction génétique, Ribosomes mitochondriaux
Auteur : Chicherin Ivan
Année de soutenance : 2016
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Analyse de la variabilité intraspécifique chez les levures : résistance à l'ammonium et aux composés azolés
Description : Dans toutes les espèces, les mutations et les réarrangements chromosomiques constituent des moteurs de l’évolution des génomes. Ils génèrent une diversité génétique à l’origine de la variation phénotypique observée entre les individus d’une même espèce. Cette variation est particulièrement importante ...
Mots clés : Réarrangement génétique, Saccharomyces cerevisiae, Génome
Auteur : Reisser Cyrielle
Année de soutenance : 2014
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Analyse des mécanismes cellulaires responsables de maladies neurodégénératives dans le modèle de la levure Saccharomyces cerevisiae : analyse fonctionnelle de myotubularines responsables de pathologies humaines
Description : Des mutations dans les gènes codant pour des myotubularines (MTM) sont responsables de maladies neuromusculaires telles que la XLCNM (MTM1) ou la CMT4 (MTMR2 & MTMR13). Les MTMs sont des phosphatases à phosphosinositides (PPIn), des messagers lipidiques essentiels pour la régulation spatio-temporelle ...
Mots clés : Maladies musculaires, Saccharomyces cerevisiae, Phospho-inositides, Phosphatases, Cytosquelette
Auteur : Bertazzi Dimitri
Année de soutenance : 2012
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Biodegradation of chloroacetanilide herbicides in wetlands
Description : Les chloroacétanilides sont une famille d'herbicides largement utilisée en agriculture, et contribuent de ce fait à la pollution environnementale. Leur devenir, y compris dans les écosystèmes rédox-dynamiques récepteurs comme les zones humides, est encore mal compris. Dans ce travail, la dégradation ...
Mots clés : Herbicides, Pollution par les pesticides, Génomique comparative, Indicateurs biologiques, Écologie des zones humides
Auteur : Elsayed Omniea
Année de soutenance : 2015
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Characterization of protein factors targeting RNA into human mitochondria
Description : L'importation de ARNtLys CUU (tRK1) de levure dans les mitochondries humaines indique que la cellule humaine possède la machinerie pour importation d'ARNt. Dans la présente étude, nous montrons que le précurseur de la lysyl-ARNt synthétase mitochondriale peut interagir avec tRK1 et ses dérivés c ...
Mots clés : Mitochondries, ARN de transfert, Translocation (génétique), Traduction génétique, Transport des ARN
Auteur : Gowher Ali
Année de soutenance : 2013
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Composition et fonctionnement d'une communauté microbienne au sein d'un drainage minier acide : approches culturales et fonctionnelles
Description : Le drainage minier acide de Carnoulès est caractérisé par un pH très acide et une forte concentration en métaux et en arsenic. Par différentes approches moléculaires, des études précédentes ont montré une faible biodiversité et ont permis d'établir un modèle de fonctionnement de la communauté ba ...
Mots clés : Écologie microbienne, Écologie des sols acides, Microorganismes
Auteur : Delavat François
Année de soutenance : 2012
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Contributions to the study of the architecture and evolution of ribozymes
Description : Les ARNnc sont impliqués dans la régulation de l’expression des gènes via divers mécanismes. Ils adoptent des structures 3D composées à 70% de pb WC formant des hélices de types A liées entre elles par des jonctions modulaires ayant des caractéristiques géométriques spécifiques. Nous avons identifié ...
Mots clés : ARN ribosomiques, Introns, Épissage (génétique), Cristallographie
Auteur : Meyer Mélanie
Année de soutenance : 2013
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Deciphering the functional and molecular differences between MTM1 and MTMR2 to better understand two neuromuscular diseases
Description : MTM1 et MTMR2 sont 2 phosphatases de phosphoinositides appartenant à la famille des myotubularines, conservée pendant l’évolution. Bien qu’étant très similaires, des mutations dans MTM1 entraînent la sévère myopathie XLCNM alors que les mutations dans MTMR2 entraînent la neuropathie CMT4B. On ne ...
Mots clés : Maladies musculaires, Thérapie génique, Myopathies congénitales structurales, Gènes liés au chromosome X
Auteur : Raess Matthieu
Année de soutenance : 2017
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Découverte de l'aminoacylation ARNt-dépendante de l'ergostérol chez les champignons
Description : Les aminoacyl-ARNt (aa-ARNt) sont essentiels à la synthèse protéique mais servent aussi de substrats dans d’autres mécanismes biologiques. Chez les bactéries, des aa-ARNt-transférases (AAT), possédant un domaine DUF2156, transfèrent l’acide aminé (aa) d’un aa-ARNt sur un glycérolipide. Ce remodelage ...
Mots clés : Microorganismes -- Pathogénicité, Aminoacyl-ARNt synthétases, Ergocalciférol, Lipides, Aminoacylation
Auteur : Yakobov Nathaniel
Année de soutenance : 2020
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Découverte et caractérisation d'une nouvelle forme de méthionyl-ARNt synthétase nucléaire chez la levure Saccharomyces cerevisiae
Description : La methionyl-ARNt synthétase (MetRS) de Saccharomyces cerevisiae aminoacyle les ARNt méthionine initiateur et élongateur (ARNtiMet et ARNteMet), mais possède également des fonctions atypiques. Nous avons montré que la MetRS rejoint le noyau durant la transition diauxique afin de réguler la trans ...
Mots clés : Saccharomyces cerevisiae, Élongation (biologie moléculaire), ARN de transfert, Traduction génétique, Aminoacyl-ARNt synthétases
Auteur : Laporte Daphné
Année de soutenance : 2016
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Development of a CRISPR-Cas12a system targeting human mitochondrial DNA
Description : Les maladies neuromusculaires chez l’homme sont souvent causées par des mutations de l’ADNmt. La gravité de ces maladies dépend du niveau d’hétéroplasmie, où l’ADNmt mutant et sauvage coexistent dans la même cellule. Le développement d'approches expérimentales permettant la manipulation de l’ADNmt ...
Mots clés : Maladies neuromusculaires, ADN mitochondrial, CRISPR (génétique)
Auteur : Nikitchina Natalia
Année de soutenance : 2023
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Développement d'une stratégie thérapeutique anti-réplicative via l'exploitation de la voie d'import des ARN dans les mitochondries humaines
Description : Les mitochondries sont impliquées dans de nombreuses voies métaboliques, et des mutations au sein de leur génome (ADNmt) conduisent à l’apparition de nombreuses pathologies. A l’heure actuelle, il n’existe aucun traitement contre ces affections mais différentes pistes thérapeutiques sont envisagées. ...
Mots clés : ADN mitochondrial, ADN -- Réplication, Oligonucléotides, Épissage (génétique), Thérapie génique
Auteur : Tonin Yann
Année de soutenance : 2013
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Diagnostic microbiologique de sites contaminés par les solvants chlorés
Description : Le potentiel de biodégradation des éthènes chlorés (ECs) et du dichlorométhane (DCM) dans les eaux souterraines de l’ancien site industriel de Themeroil (Varennes-le-Grand, France) a été évalué par des études en microcosmes, à travers l’utilisation de biomarqueurs moléculaires, et par analyse is ...
Mots clés : Eaux souterraines, Hydrocarbures chlorés, Analyse par dilution isotopique, Marqueurs biologiques
Auteur : Hermon Louis
Année de soutenance : 2017
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Dissection de la relation génotype-phénotype par des études d'association chez Saccharomyces cerevisiae
Description : Un objectif central en biologie est de comprendre la relation entre le génotype et le phénotype. Afin de disséquer les bases génétiques de la diversité phénotypique, il est nécessaire de disposer d’une collection de données génomiques d’un grand nombre d’individus d’une même espèce. Dans ce but, ...
Mots clés : Métagénomique, Étude d'association pangénomique, Saccharomyces cerevisiae
Auteur : Peter Jackson
Année de soutenance : 2017
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Dissection of the phenotypic expressivity across a natural population
Description : L’élucidation des origines génétiques des traits complexes reste une problématique majeure en biologie. Ces dix dernières années, les projets de reséquençage de milliers d’individus d’une même espèce ont permis d’explorer la diversité génétique au sein des génomes. Des études d’association pangé ...
Mots clés : Génétique des populations, Phénotype, Saccharomyces cerevisiae
Auteur : Caudal Élodie
Année de soutenance : 2021
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Diversité génomique et fonctionnelle de bactéries du genre Thiomonas isolées du drainage minier acide de Carnoulès (Gard)
Description : Les liens entre la diversité et l'adaptation des populations bactériennes à leur environnement constituent une problématique importante en écologie microbienne. L'accès à de nombreux génomes permet aujourd'hui des avancées intéressantes dans ce domaine. Plusieurs souches du genre Thiomonas et ap ...
Mots clés : Bactéries, Génomique comparative, Arsénites (chimie), Écologie bactérienne, Exhaure acide, Stress oxydatif
Auteur : Farasin Julien
Année de soutenance : 2015
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Dynamique moléculaire de la méthionyl-ARNt-synthétase et ses nouvelles fonctions non canoniques chez la levure S. cerevisiae
Description : Les aminoacyl-ARNt synthétases (aaRSs) sont des enzymes essentielles et ubiquitaires dont la fonction canonique est de catalyser la formation des aa-ARNt utilisés dans la synthèse protéique. Cependant leur role ne se limite pas à cette seule fonction enzymatique : les aaRSs ont acquis la capacité ...
Mots clés : Saccharomyces cerevisiae, Aminoacyl-ARNt synthétases, ARN de transfert de la méthionine, Methionine-tRNA ligase
Auteur : Debard Sylvain
Année de soutenance : 2019
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Dynamique moléculaire de la méthionyl-ARNt-synthétase et ses nouvelles fonctions non canoniques chez la levure S. cerevisiae
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Étude de la survie de contaminants bactériens modèles d’origine industrielle, isolés d’environnements oligotrophes, et élaboration de milieux synthétiques permettant leur croissance
Description : La mise au point de milieux de culture permettant de mettre en évidence rapidement et de manière reproductible des micro-organismes exigeants représenterait une évolution significative dans le contrôle des produits et procédés industriels. Deux milieux de culture synthétiques ont été élaborés pour ...
Mots clés : Écologie bactérienne, Micropolluants, Bactéries, Cultures microbiennes, Biofilms
Auteur : Gillmann Antoine
Année de soutenance : 2015
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Étude de la survie de contaminants bactériens modèles d’origine industrielle, isolés d’environnements oligotrophes, et élaboration de milieux synthétiques permettant leur croissance
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