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Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg ; 1992-....)
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Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg ; 1992-....)
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From functional study of tRNA CCA-adding enzymes toward their characterization by serial X-ray crystallography
Résumé
:
La dernière décennie marque d'importantes évolutions dans le domaine de la biologie structurale, en particulier dans la cristallographie sérielle aux rayons X résolue en temps. L’objectif de cette thèse en cotutelle entre les universités de Strasbourg et de Leipzig, était d’appliquer cette approche ...
Mots clés
:
Radiocristallographie, ARN de transfert, Complexes multienzymatiques
Auteur
:
Rollet Kévin
Année de soutenance
:
2022
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From functional study of tRNA CCA-adding enzymes toward their characterization by serial X-ray crystallography
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Functional exploration of the Plasmodium tRNA import machinery
Résumé
:
Ma thèse s’articule autour de la caractérisation fonctionnelle de la protéine tRip (tRNA import protein), une protéine membranaire, présente à la surface de Plasmodium, le parasite responsable de la malaria. tRip comporte 2 domaines : (i) le domaine N-terminal de type "GST-like" qui en liant des ...
Mots clés
:
Protéines membranaires, Paludisme, ARN de transfert
Auteur
:
Pitolli Martina
Année de soutenance
:
2023
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Functional exploration of the Plasmodium tRNA import machinery
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Genomic and biochemical characterization of a bacterial homolog of Selenoprotein N, a selenium-containing protein involved in congenital muscular dystrophy
Résumé
:
La sélénoprotéine N (SelenoN) est une protéine transmembranaire du réticulum endoplasmique. Des mutations dans le gène SELENON ont été associées à différentes formes héréditaires de maladies musculaires chez l'homme et il a été démontré que la protéine SelenoN est impliquée dans le développement ...
Mots clés
:
Sélénoprotéine T, Symbiose
Auteur
:
Mahboub Nedaa Yousef
Année de soutenance
:
2023
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Genomic and biochemical characterization of a bacterial homolog of Selenoprotein N, a selenium-containing protein involved in congenital muscular dystrophy
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Identification des cibles primaires des ARN non codant de Staphylococcus aureus et de leurs réseaux de régulation : mise au point des approches MAPS et Grad-seq
Résumé
:
S. aureus est une bactérie pathogène opportuniste de l’homme qui pose un grave problème de santé publique. Le pouvoir pathogène de S. aureus est conféré par un très grand nombre de facteurs de virulence, dont l’expression est finement régulée à de multiples niveaux. Les effecteurs de cette régulation ...
Mots clés
:
ARN non codants, Staphylocoque doré, Régulation génétique, Virulence (microbiologie)
Auteur
:
Tomasini Arnaud
Année de soutenance
:
2016
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Identification des cibles primaires des ARN non codant de Staphylococcus aureus et de leurs réseaux de régulation : mise au point des approches MAPS et Grad-seq
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Identification et caractérisation de facteurs impliqués dans la réponse cellulaire aux ARN double brin
Résumé
:
Tous les organismes sont en permanence soumis à des attaques par des agents pathogènes dont le matériel génétique est perçu comme étranger par la cellule. Pour se protéger de ces dangers potentiels, différents mécanismes inhibiteurs permettant de percevoir et d’agir directement sur cette information ...
Mots clés
:
ARN bicaténaire, Microorganismes, ARN interférence
Auteur
:
Petitjean Olivier
Année de soutenance
:
2020
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Identification et caractérisation de facteurs impliqués dans la réponse cellulaire aux ARN double brin
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Identification et caractérisation fonctionnelle de protéines impliquées dans la régulation de la biogénèse de miARN viraux
Résumé
:
Les microARNs sont des régulateurs post-transcriptionnelles de l’expression géniques. Partagé par tous les eucaryotes et certains virus, la compréhension de leur régulation est indispensable pour comprendre la physiologie cellulaire. Les précurseurs de microARN peuvent être exprimé individuellement ...
Mots clés
:
MicroARN, ARN viral, Herpèsvirus humain de type 8, Épissage (génétique), Chromatographie
Auteur
:
Creugny Antoine
Année de soutenance
:
2019
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Identification et caractérisation fonctionnelle de protéines impliquées dans la régulation de la biogénèse de miARN viraux
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Identification et étude des partenaires cellulaires impliqués dans la régulation du facteur antiviral APOBEC3G par la protéine Vif du VIH-1 : l'E3 ubiquitine-ligase CHIP, un nouvel acteur de ces mécanismes ?
Résumé
:
Le facteur de restriction APOBEC3G (A3G) inhibe l’infection de divers virus, dont le VIH-1. Celui-ci réprime en retour l’expression d’A3G grâce à sa protéine Vif. Une des actions de Vif, encore peu caractérisée, est l’inhibition de la traduction d’A3G. Ma thèse a contribué à l’étude d’un uORF situé ...
Mots clés
:
Protéines virales, Antiviraux, VIH (virus)
Auteur
:
Verriez Cédric
Année de soutenance
:
2023
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Identification et étude des partenaires cellulaires impliqués dans la régulation du facteur antiviral APOBEC3G par la protéine Vif du VIH-1 : l'E3 ubiquitine-ligase CHIP, un nouvel acteur de ces mécanismes ?
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Identification of specific phylogenetic properties of HIV-1 M and O integrases
Résumé
:
Les transmissions de virus simiens à l'homme ont donné naissance aux différents groupes de VIH-1. Nous avons récemment identifié un motif fonctionnel (CLA), dans le domaine C-terminal de l'intégrase, essentiel pour l'intégration dans le groupe M. Ici, nous avons constaté que le motif est dispensable ...
Mots clés
:
Intégrase du VIH, Protéines virales, Phylogénie
Auteur
:
Toccafondi Elenia
Année de soutenance
:
2022
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Identification of specific phylogenetic properties of HIV-1 M and O integrases
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Immunité innée et contre-mesures virales : études structurales et biophysiques du complexe formé entre la cytidine désaminase humaine APOBEC3G et le facteur d'infectivité virale du VIH-1
Résumé
:
La protéine Vif (Viral infectivity factor) joue un rôle essentiel dans la réplication virale et dans le pouvoir infectieux du VIH-1. Elle est aussi qualifiée de « protéine de contre-défense » car elle neutralise un facteur cellulaire à action antivirale, APOBEC3 en recrutant le complexe de la E3 ...
Mots clés
:
Infections à VIH, Antiprotéases du VIH, ARN -- Réplication, Résistance aux maladies, Cristallographie, VIH-1 (Virus de l'Immunodéficience Humaine de type 1), Gènes vif
Auteur
:
Mezher Joelle
Année de soutenance
:
2015
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Immunité innée et contre-mesures virales : études structurales et biophysiques du complexe formé entre la cytidine désaminase humaine APOBEC3G et le facteur d'infectivité virale du VIH-1
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Impact of genetic reassortment on the structure of RNA genomic segments of human Influenza A viruses
Résumé
:
Les virus de la grippe A (IAV) sont connus pour leurs épidémies annuelles et leurs pandémies occasionnelles. Le génome segmenté de l’IAV facilite le réassortiment génétique, permettant aux virus d’échanger des segments entiers lors de la co-infection avec des souches génétiquement homologues. Cela ...
Mots clés
:
Influenzavirus A, Génomique, Virus à ARN
Auteur
:
Paul Stansilaus Rithu
Année de soutenance
:
2024
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Impact of genetic reassortment on the structure of RNA genomic segments of human Influenza A viruses
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Import des ARNt dans Plasmodium : sélection à l'entrée ?
Résumé
:
Mon étude a porté sur la spécificité de l'interaction entre deux protéines du parasite du paludisme (Plasmodium), tRip (tRNA import protein) et la tyrosyl-ARNt synthétase apicoplastique (api-TyrRS), avec l'ARN de transfert (ARNt). Plasmodium est un parasite intracellulaire qui conserve une organelle ...
Mots clés
:
ARN de transfert, ARN -- Modifications posttranscriptionnelles, Aminoacyl-ARNt synthétases, Paludisme
Auteur
:
Cela Madinaveitia Marta
Année de soutenance
:
2018
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Import des ARNt dans Plasmodium : sélection à l'entrée ?
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Inhibition traductionnelle du facteur de restriction APOBEC3G par la protéine Vif du VIH-1 : rôle d'une uORF dans la 5'-UTR de l'ARNm d'A3G et identification de facteurs cellulaires
Résumé
:
La protéine Vif du VIH-1 contrecarre le facteur de restriction APOBEC3G (A3G) en diminuant son niveau d'expression dans les cellules infectées. Ceci est mis en œuvre entre autres par l'inhibition de sa traduction, un mécanisme encore peu compris. La première partie de ma thèse contribue à la car ...
Mots clés
:
VIH (virus), Protéines virales, Protéines -- Modifications posttraductionnelles, Produits du gène vif du virus de l'immunodéficience humaine
Auteur
:
Seissler Tanja
Année de soutenance
:
2019
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Inhibition traductionnelle du facteur de restriction APOBEC3G par la protéine Vif du VIH-1 : rôle d'une uORF dans la 5'-UTR de l'ARNm d'A3G et identification de facteurs cellulaires
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Interaction des segments d’ARN génomique du virus Influenza A avec la nucléoprotéine virale NP : impact structural et implications pour l’encapsidation du génome
Résumé
:
Les virus Influenza A possèdent un génome segmenté en 8 ARN génomiques, impliqués dans des épidémies saisonnières et des pandémies occasionnelles. La complexité de leur génome requiert un mécanisme afin d’empaqueter un exemplaire de chaque ARN viral, afin d’obtenir des particules virales infectieuses. ...
Mots clés
:
Interactions ADN-protéine, Influenzavirus A, Empaquetage de l'ADN
Auteur
:
Quignon Erwan
Année de soutenance
:
2022
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Interaction des segments d’ARN génomique du virus Influenza A avec la nucléoprotéine virale NP : impact structural et implications pour l’encapsidation du génome
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La protéine ribosomique S1 d'Escherichia coli au carrefour de la traduction et de la régulation de l'expression des gènes
Résumé
:
La traduction est une étape clef de l’expression des gènes, et mon travail a consisté à étudier l’implication de la protéine ribosomique S1 d’Escherichia coli dans l’initiation de la traduction des ARNm structurés. Mes résultats montrent que 1) S1 est requise pour la formation du complexe d’initiation ...
Mots clés
:
Ribosomes, ARN ribosomiques, Escherichia coli, Régulation génétique
Auteur
:
Duval Mélodie
Année de soutenance
:
2015
Restriction d'accès permanente : confidentialité ou accès intranet uniquement
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La protéine ribosomique S1 d'Escherichia coli au carrefour de la traduction et de la régulation de l'expression des gènes
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Le piratage de l'appareil de traduction de la cellule hôte par le virus de la paralysie du criquet (CrPV)
Résumé
:
Le Virus de la Paralysie du Cricket (CrPV) est un virus à ARN qui utilise des « sites d’entrée interne du ribosome » (IRES) pour détourner la machinerie traductionnelle de son hôte et synthétiser ses protéines virales. La traduction de ses deux phases codantes (ORF) est contrôlée par deux IRES d ...
Mots clés
:
ARN viral, Site d'entrée interne des ribosomes, Traduction génétique, Catantopidés, Relations hôte-virus
Auteur
:
Gross Lauriane
Année de soutenance
:
2018
Restriction d'accès permanente : confidentialité ou accès intranet uniquement
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Le piratage de l'appareil de traduction de la cellule hôte par le virus de la paralysie du criquet (CrPV)
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Mécanismes et évolution des complexes ribonucléoprotéiques responsables de la biosynthèse ARNt-dépendante des acides aminés
Résumé
:
La traduction implique l’utilisation d’aminoacyl-ARNt produits par les aminoacyl-ARNt synthétases (aaRS). Il devrait exister 20 aaRS, une spécifique de chaque acide aminé. Or, les données actuelles montrent qu’une grande majorité des organismes ne possèdent pas l’asparaginyl- (AsnRS) et/ou la gl ...
Mots clés
:
Nucléoprotéines, Traduction génétique, Aminoacyl-ARNt synthétases, ARN de transfert
Auteur
:
Fischer Frédéric
Année de soutenance
:
2012
Restriction d'accès permanente : confidentialité ou accès intranet uniquement
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Mécanismes et évolution des complexes ribonucléoprotéiques responsables de la biosynthèse ARNt-dépendante des acides aminés
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Mécanismes moléculaires gouvernant la sélection et l'encapsidation de l'ARN génomique du VIH-1 : l’encapsidation sélective de l’ARN génomique du VIH-1
Résumé
:
La sélection de l’ARNg des rétrovirus repose sur des interactions entre le domaine nucléocapside (NC) du précurseur Gag et des régions de l’ARN viral appelées ψ (ou Psi) localisées dans la région 5’ non traduite (5’-UTR) de l’ARNg et/ou dans le début du gène gag.Malgré des nombreuses études, les ...
Mots clés
:
VIH (virus), ARN viral, ARN -- Réplication, Épissage (génétique), Dimérisation
Auteur
:
Wassim Ekram
Année de soutenance
:
2012
Restriction d'accès permanente : confidentialité ou accès intranet uniquement
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Mécanismes moléculaires gouvernant la sélection et l'encapsidation de l'ARN génomique du VIH-1 : l’encapsidation sélective de l’ARN génomique du VIH-1
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Molecular and structural bases of selenoprotein N dysfunction in diverse forms of congenital muscular dystrophies
Résumé
:
Les Selenoprotéines sont des protéines contenant un résidu sélénocystéine (U) dans leur séquence en acide amines. Vingt-cinq sélénoprotéines constituent le sélénoprotéome humain. Parmi elles, la sélénoprotéine N ou SelenoN ; des mutations dans le gène SELENON donnent lieu à un groupe de dystrophies ...
Mots clés
:
Protéome, Mutation (biologie), Maladies musculaires, Sélénoprotéines
Auteur
:
Dacleu Siewe Vanessa
Année de soutenance
:
2017
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Molecular and structural bases of selenoprotein N dysfunction in diverse forms of congenital muscular dystrophies
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Organisation sous-mitochondriale de l'aspartyl-ARNt synthétase humaine et implication dans le syndrome LBSL
Résumé
:
Les travaux présentés dans cette thèse ont eu pour objectif de contribuer à la compréhension du lien entre l’aspartyl-ARNt synthétase mitochondriale (AspRSmt) humaine et le syndrome LBSL, en étudiant les propriétés de cette enzyme au niveau cellulaire. Les objectifs étaient : 1) d’explorer l’org ...
Mots clés
:
Leucoencéphalopathies, ADN mitochondrial, Traduction génétique, Aminoacyl-ARNt synthétases
Auteur
:
Karim Loukmane
Année de soutenance
:
2016
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Organisation sous-mitochondriale de l'aspartyl-ARNt synthétase humaine et implication dans le syndrome LBSL
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Recherche de signaux d'empaquetage spécifiques du génome des virus influenza A
Résumé
:
Les huit ARN viraux (ARNv) génomiques des influenzavirus de type A sont sélectivement empaquetés dans les virions, vraisemblablement sous la forme d’un complexe supramoléculaire maintenu par des appariements ARN/ARN entre signaux d’empaquetage. Afin d’améliorer la compréhension des règles qui go ...
Mots clés
:
Influenzavirus A, ARN viral, Virus -- Reproduction (biologie), Mutagénèse dirigée, ARN interférence, Virion, Interférence par ARN
Auteur
:
Gerber Marie
Année de soutenance
:
2016
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Recherche de signaux d'empaquetage spécifiques du génome des virus influenza A
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