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Mécanismes moléculaires gouvernant la sélection et l'encapsidation de l'ARN génomique du VIH-1 : l’encapsidation sélective de l’ARN génomique du VIH-1
Résumé : La sélection de l’ARNg des rétrovirus repose sur des interactions entre le domaine nucléocapside (NC) du précurseur Gag et des régions de l’ARN viral appelées ψ (ou Psi) localisées dans la région 5’ non traduite (5’-UTR) de l’ARNg et/ou dans le début du gène gag.Malgré des nombreuses études, les ...
Mots clés : VIH (virus), ARN viral, ARN -- Réplication, Épissage (génétique), Dimérisation
Auteur : Wassim Ekram
Année de soutenance : 2012
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Mécanismes moléculaires gouvernant la sélection et l'encapsidation de l'ARN génomique du VIH-1 : l’encapsidation sélective de l’ARN génomique du VIH-1
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Molecular and structural bases of selenoprotein N dysfunction in diverse forms of congenital muscular dystrophies
Résumé : Les Selenoprotéines sont des protéines contenant un résidu sélénocystéine (U) dans leur séquence en acide amines. Vingt-cinq sélénoprotéines constituent le sélénoprotéome humain. Parmi elles, la sélénoprotéine N ou SelenoN ; des mutations dans le gène SELENON donnent lieu à un groupe de dystrophies ...
Mots clés : Protéome, Mutation (biologie), Maladies musculaires, Sélénoprotéines
Auteur : Dacleu Siewe Vanessa
Année de soutenance : 2017
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Molecular and structural bases of selenoprotein N dysfunction in diverse forms of congenital muscular dystrophies
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Organisation sous-mitochondriale de l'aspartyl-ARNt synthétase humaine et implication dans le syndrome LBSL
Résumé : Les travaux présentés dans cette thèse ont eu pour objectif de contribuer à la compréhension du lien entre l’aspartyl-ARNt synthétase mitochondriale (AspRSmt) humaine et le syndrome LBSL, en étudiant les propriétés de cette enzyme au niveau cellulaire. Les objectifs étaient : 1) d’explorer l’org ...
Mots clés : Leucoencéphalopathies, ADN mitochondrial, Traduction génétique, Aminoacyl-ARNt synthétases
Auteur : Karim Loukmane
Année de soutenance : 2016
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Recherche de signaux d'empaquetage spécifiques du génome des virus influenza A
Résumé : Les huit ARN viraux (ARNv) génomiques des influenzavirus de type A sont sélectivement empaquetés dans les virions, vraisemblablement sous la forme d’un complexe supramoléculaire maintenu par des appariements ARN/ARN entre signaux d’empaquetage. Afin d’améliorer la compréhension des règles qui go ...
Mots clés : Influenzavirus A, ARN viral, Virus -- Reproduction (biologie), Mutagénèse dirigée, ARN interférence, Virion, Interférence par ARN
Auteur : Gerber Marie
Année de soutenance : 2016
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Régulation de l’homéostasie du zinc et du manganèse chez Staphylococcus aureus : implication des ARN régulateurs ZinS et RsaC
Résumé : Lors d’une infection à Staphylococcus aureus, pathogène majeur de l’Homme, les cellules immunitaires séquestrent des métaux qui sont essentiels à la croissance du pathogène (Mn2+, Zn2+), à travers la dégranulation de la calprotectine. Lors de ma thèse, j’ai caractérisé un ARN régulateur (sARN) nommé ...
Mots clés : Homéostasie, Staphylocoque doré, ARN régulateur
Auteur : Charbonnier Mathilde
Année de soutenance : 2024
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Rôle de l'import des ARN de transfert de l'hôte dans le développement Plasmodium
Résumé : La protéine tRip de Plasmodium, l’agent du paludisme, fait l’objet de mon travail de thèse. Identifiée au laboratoire, elle est localisée à la membrane plasmique de P. berghei, le modèle murin étudié in vivo. Elle permet l’import d’ARNt exogènes à l’intérieur du parasite. La génération et l’étude ...
Mots clés : Plasmodium falciparum, Relations hôte-parasite, Transcription génétique, ARN de transfert, Synthèse protéique
Auteur : Kapps Delphine
Année de soutenance : 2016
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Rôle de la sélénoprotéine N dans les réseaux de régulation rédox : études physiologique et transcriptomique
Résumé : La réponse au stress oxydatif joue un rôle important dans de nombreux processus d’adaptation biologique. Les sélénoprotéines jouent un rôle clef dans le contrôle du stress oxydatif. Des mutations du gène codant pour la sélénoproteine N (SelN) sont la cause de différentes formes de dystrophies mu ...
Mots clés : Maladies neuromusculaires, Expression génique, Protéines musculaires, Stress oxydatif, Sélénium dans l'organisme, Sélénoprotéines
Auteur : Briens Mickaël
Année de soutenance : 2014
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Rôle du facteur d'initiation eIF3 dans la traduction de l'ARNm de l'histone H4
Résumé : La traduction de l’ARNm de l’histone H4 est initiée par un mécanisme original combinant à la fois certaines caractéristiques canoniques (fixation à la coiffe) et virales (absence de scanning et entrée interne des ribosomes). Le facteur d’initiation eIF3, un complexe de 13 sous-unités (a-m), assure ...
Mots clés : Histones, ARN messagers, Traduction génétique, Initiation de la traduction, Histone, Facteur-3 d'initiation eucaryote
Auteur : Hayek Hassan Alaskari
Année de soutenance : 2019
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Role of HIV-1 Vif in viral replication : translational regulation of APOBEC3G and RNA chaperone activity
Résumé : Vif (Viral Infectivity Factor) est une protéine auxiliaire qui augmente le «fitness» viral dans l’hôte infecté. Vif est essentielle à la formation de particules virales infectieuses dans les cellules dites «non-permissives», alors que des virus ΔVif se répliquent efficacement dans des lignées ce ...
Mots clés : VIH (virus), Protéines virales, ARN -- Réplication, Interactions ARN-protéine, Traduction génétique, Produits du gène vif du virus de l'immunodéficience humaine
Auteur : Guerrero Santiago
Année de soutenance : 2013
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Role of human Dicer helicase domain upon viral infection
Résumé : Les cellules eucaryotes font face aux infections virales grâce à deux réponses immunitaires : l’interférence à l’ARN (ARNi) chez les invertébrés et les plantes et la réponse interféron de type I (IFN-I) chez les mammifères. Chez ces derniers, le rôle de l’ARNi dans la réponse antivirale est débattu, ...
Mots clés : Protéines virales, ARN interférence, Réponse immunitaire
Auteur : Baldaccini Morgane
Année de soutenance : 2023
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Shigella : régulation de l’expression des SPATEs dépendante de l’oxygène et étude de leur(s) fonction(s)
Résumé : Les shigelles sont des entérobactéries pathogènes à Gram négative. Elles ont développé des stratégies leur permettant de s’adapter aux changements de l’environnement rencontrés au cours de leur cycle de virulence. Les systèmes de sécrétion ont un rôle primordial à différentes étapes ...
Mots clés : Shigelles, Virulence (microbiologie), Bactéries
Auteur : Laborde Matthieu
Année de soutenance : 2022
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Staphylococcus aureus protein S1, an RNA chaperone involved in translation initiation and sRNA regulation
Résumé : Bien que l'initiation de la traduction soit un processus conservé entre les bactéries, nous avons montré que le mécanisme par lequel les ARNm structurés sont reconnus et adaptés sur le ribosome diffère chez Staphylococcus aureus, un micro-organisme avec un bas taux de G+C et chez Escherichia coli. ...
Mots clés : Protéines bactériennes, Traduction génétique, Staphylococcus aureus, Virulence (microbiologie)
Auteur : Marenna Alessandra
Année de soutenance : 2017
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Structural and functional characterisation of the 5’ untranslated regions of β-catenin and HIF-1α mRNAs and their translational role in cancer cells under hypoxia
Résumé : La synthèse des protéines est principalement régulée au stade de l'initiation pour permettre un contrôle rapide et réversible des changements cellulaires et environnementaux. Ils existent des mécanismes non conventionnels d'initiation de la traduction pour le recrutement du ribosome à partir de ...
Mots clés : Synthèse protéique, Cancer, ARN messagers
Auteur : Rol Moreno Javier
Année de soutenance : 2022
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Structural characterization of proteinaceous RNase P from Arabidopsis thaliana
Résumé : La maturation des ARNt en 5' est réalisée par RNase P. C'est un ribozyme chez les bactéries, les fungi et les nuclei des mammifères et un enzyme protéique dans les plantes ou des organelles des mammifères qui s’appelle PRORP. Il y a trois PRORP dans A. thaliana. PRORP contiennent deux domaines : ...
Mots clés : ARN de transfert, Ribonucléases, Arabidopsis thaliana, Cristallisation, Maturation post-transcriptionnelle des ARN
Auteur : Pinker Franziska
Année de soutenance : 2014
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Structural differences and specificities of mRNA translation initiation complexes between trypanosomes and their hosts
Résumé : Les kinétoplastides sont un groupe de protozoaires flagellés dont quelques espèces parasites exclusives causent des maladies menaçant plusieurs millions de personnes à travers le monde. Etant des espèces eucaryotes parasitant d’autres espèces eucaryotes comme les mammifères, il existe une forte ...
Mots clés : Protozoaires pathogènes, Trypanosoma, Relations hôte-virus, Traduction génétique
Auteur : Bochler Anthony
Année de soutenance : 2020
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Structural rearrangements of the HIV-1 genomic RNA during maturation of the viral particle
Résumé : Le VIH-1 bourgeonne sous forme immature et doit subir l’étape de maturation afin d’acquérir son caractère infectieux. La maturation protéolytique du précurseur Pr55Gag induit le réarrangement morphologique de la particule alors que le dimère d’ARNg acquiert une compaction optimale. Ces réarrangements ...
Mots clés : Infections à VIH, Épissage (génétique), Génomique, ARN viral, Molécules chaperonnes
Auteur : Mailler Élodie
Année de soutenance : 2017
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Structural study of mRNA translation in kinetoplastids by Cryo-electron microscopy
Résumé : Les kinétoplastides sont un groupe de protozoaires, et qui menace plus de 400 millions de personnes dans le monde entier. Ils possèdent des segments d'expansion d'ARNr (SE) inhabituellement plus larges dans les sous-unités 40S. Ici, nous avons purifié à partir de lysats de cellules de T. cruzi ...
Mots clés : Cryomicroscopie, Traduction génétique, ARN ribosomique
Auteur : Brito Querido Jailson Fernando
Année de soutenance : 2017
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Structure and evolution of animal mitochondrial tRNAs
Résumé : Les approches bioinformatiques développées au cours de cette thèse ont permis d’une part le développement de banques de données concernant les ARNt classiques ainsi que les ARNt mitochondriaux de métazoaires. Celles-ci sont basées sur de nouveaux outils pour la détection de gènes d’ARNt «bizarres» ...
Mots clés : ARN de transfert, Métazoaires, Mitochondries, Bases de données d'acides nucléiques
Auteur : Jühling Frank
Année de soutenance : 2013
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Structure and evolution of animal mitochondrial tRNAs
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Structure de l'ARN au sein des ribonucléoprotéines des Influenzavirus A
Résumé : Le génome des Influenzavirus A est constitué de huit segments d’ARN de polarité négative formant des ribonucléoprotéines virales (RNPv). La segmentation du génome complique l’empaquetage du génome, puisqu’un jeu complet de segments est nécessaire à l’infectiosité des virus. Il est aujourd’hui admis ...
Mots clés : Influenzavirus A, Nucléoprotéines, Molécules chaperonnes, Protéines virales, Interactions ARN-protéine
Auteur : Ferhadian Damien
Année de soutenance : 2018
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Study of mechanisms regulating the biogenesis of microRNAs expressed by Kaposi’s sarcoma-associated herpesvirus
Résumé : Les microARN (miARN) sont d’importants régulateurs de l’expression génique exprimés par presque tous les eucaryotes, ainsi que certains de leurs virus associés. Dans le cadre de ce projet, nous avons étudié la biogenèse d’un cluster de miARN exprimé par un oncovirus humain, l’Herpèsvirus associé ...
Mots clés : MicroARN, Herpes simplex virus, Régulation génétique
Auteur : Vilimova Monika
Année de soutenance : 2022
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Study of mechanisms regulating the biogenesis of microRNAs expressed by Kaposi’s sarcoma-associated herpesvirus
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