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Régulation de l’homéostasie du zinc et du manganèse chez Staphylococcus aureus : implication des ARN régulateurs ZinS et RsaC
Résumé : Lors d’une infection à Staphylococcus aureus, pathogène majeur de l’Homme, les cellules immunitaires séquestrent des métaux qui sont essentiels à la croissance du pathogène (Mn2+, Zn2+), à travers la dégranulation de la calprotectine. Lors de ma thèse, j’ai caractérisé un ARN régulateur (sARN) nommé ...
Mots clés : Homéostasie, Staphylocoque doré, ARN régulateur
Auteur : Charbonnier Mathilde
Année de soutenance : 2024
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Régulation de l’homéostasie du zinc et du manganèse chez Staphylococcus aureus : implication des ARN régulateurs ZinS et RsaC
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Rôle de l'import des ARN de transfert de l'hôte dans le développement Plasmodium
Résumé : La protéine tRip de Plasmodium, l’agent du paludisme, fait l’objet de mon travail de thèse. Identifiée au laboratoire, elle est localisée à la membrane plasmique de P. berghei, le modèle murin étudié in vivo. Elle permet l’import d’ARNt exogènes à l’intérieur du parasite. La génération et l’étude ...
Mots clés : Plasmodium falciparum, Relations hôte-parasite, Transcription génétique, ARN de transfert, Synthèse protéique
Auteur : Kapps Delphine
Année de soutenance : 2016
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Rôle de la sélénoprotéine N dans les réseaux de régulation rédox : études physiologique et transcriptomique
Résumé : La réponse au stress oxydatif joue un rôle important dans de nombreux processus d’adaptation biologique. Les sélénoprotéines jouent un rôle clef dans le contrôle du stress oxydatif. Des mutations du gène codant pour la sélénoproteine N (SelN) sont la cause de différentes formes de dystrophies mu ...
Mots clés : Maladies neuromusculaires, Expression génique, Protéines musculaires, Stress oxydatif, Sélénium dans l'organisme, Sélénoprotéines
Auteur : Briens Mickaël
Année de soutenance : 2014
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Rôle du facteur d'initiation eIF3 dans la traduction de l'ARNm de l'histone H4
Résumé : La traduction de l’ARNm de l’histone H4 est initiée par un mécanisme original combinant à la fois certaines caractéristiques canoniques (fixation à la coiffe) et virales (absence de scanning et entrée interne des ribosomes). Le facteur d’initiation eIF3, un complexe de 13 sous-unités (a-m), assure ...
Mots clés : Histones, ARN messagers, Traduction génétique, Initiation de la traduction, Histone, Facteur-3 d'initiation eucaryote
Auteur : Hayek Hassan Alaskari
Année de soutenance : 2019
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Role of HIV-1 Vif in viral replication : translational regulation of APOBEC3G and RNA chaperone activity
Résumé : Vif (Viral Infectivity Factor) est une protéine auxiliaire qui augmente le «fitness» viral dans l’hôte infecté. Vif est essentielle à la formation de particules virales infectieuses dans les cellules dites «non-permissives», alors que des virus ΔVif se répliquent efficacement dans des lignées ce ...
Mots clés : VIH (virus), Protéines virales, ARN -- Réplication, Interactions ARN-protéine, Traduction génétique, Produits du gène vif du virus de l'immunodéficience humaine
Auteur : Guerrero Santiago
Année de soutenance : 2013
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Role of human Dicer helicase domain upon viral infection
Résumé : Les cellules eucaryotes font face aux infections virales grâce à deux réponses immunitaires : l’interférence à l’ARN (ARNi) chez les invertébrés et les plantes et la réponse interféron de type I (IFN-I) chez les mammifères. Chez ces derniers, le rôle de l’ARNi dans la réponse antivirale est débattu, ...
Mots clés : Protéines virales, ARN interférence, Réponse immunitaire
Auteur : Baldaccini Morgane
Année de soutenance : 2023
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Shigella : régulation de l’expression des SPATEs dépendante de l’oxygène et étude de leur(s) fonction(s)
Résumé : Les shigelles sont des entérobactéries pathogènes à Gram négative. Elles ont développé des stratégies leur permettant de s’adapter aux changements de l’environnement rencontrés au cours de leur cycle de virulence. Les systèmes de sécrétion ont un rôle primordial à différentes étapes ...
Mots clés : Shigelles, Virulence (microbiologie), Bactéries
Auteur : Laborde Matthieu
Année de soutenance : 2022
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Staphylococcus aureus protein S1, an RNA chaperone involved in translation initiation and sRNA regulation
Résumé : Bien que l'initiation de la traduction soit un processus conservé entre les bactéries, nous avons montré que le mécanisme par lequel les ARNm structurés sont reconnus et adaptés sur le ribosome diffère chez Staphylococcus aureus, un micro-organisme avec un bas taux de G+C et chez Escherichia coli. ...
Mots clés : Protéines bactériennes, Traduction génétique, Staphylococcus aureus, Virulence (microbiologie)
Auteur : Marenna Alessandra
Année de soutenance : 2017
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Structural and functional characterisation of the 5’ untranslated regions of β-catenin and HIF-1α mRNAs and their translational role in cancer cells under hypoxia
Résumé : La synthèse des protéines est principalement régulée au stade de l'initiation pour permettre un contrôle rapide et réversible des changements cellulaires et environnementaux. Ils existent des mécanismes non conventionnels d'initiation de la traduction pour le recrutement du ribosome à partir de ...
Mots clés : Synthèse protéique, Cancer, ARN messagers
Auteur : Rol Moreno Javier
Année de soutenance : 2022
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Structural characterization of proteinaceous RNase P from Arabidopsis thaliana
Résumé : La maturation des ARNt en 5' est réalisée par RNase P. C'est un ribozyme chez les bactéries, les fungi et les nuclei des mammifères et un enzyme protéique dans les plantes ou des organelles des mammifères qui s’appelle PRORP. Il y a trois PRORP dans A. thaliana. PRORP contiennent deux domaines : ...
Mots clés : ARN de transfert, Ribonucléases, Arabidopsis thaliana, Cristallisation, Maturation post-transcriptionnelle des ARN
Auteur : Pinker Franziska
Année de soutenance : 2014
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Structural differences and specificities of mRNA translation initiation complexes between trypanosomes and their hosts
Résumé : Les kinétoplastides sont un groupe de protozoaires flagellés dont quelques espèces parasites exclusives causent des maladies menaçant plusieurs millions de personnes à travers le monde. Etant des espèces eucaryotes parasitant d’autres espèces eucaryotes comme les mammifères, il existe une forte ...
Mots clés : Protozoaires pathogènes, Trypanosoma, Relations hôte-virus, Traduction génétique
Auteur : Bochler Anthony
Année de soutenance : 2020
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Structural rearrangements of the HIV-1 genomic RNA during maturation of the viral particle
Résumé : Le VIH-1 bourgeonne sous forme immature et doit subir l’étape de maturation afin d’acquérir son caractère infectieux. La maturation protéolytique du précurseur Pr55Gag induit le réarrangement morphologique de la particule alors que le dimère d’ARNg acquiert une compaction optimale. Ces réarrangements ...
Mots clés : Infections à VIH, Épissage (génétique), Génomique, ARN viral, Molécules chaperonnes
Auteur : Mailler Élodie
Année de soutenance : 2017
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Structural study of mRNA translation in kinetoplastids by Cryo-electron microscopy
Résumé : Les kinétoplastides sont un groupe de protozoaires, et qui menace plus de 400 millions de personnes dans le monde entier. Ils possèdent des segments d'expansion d'ARNr (SE) inhabituellement plus larges dans les sous-unités 40S. Ici, nous avons purifié à partir de lysats de cellules de T. cruzi ...
Mots clés : Cryomicroscopie, Traduction génétique, ARN ribosomique
Auteur : Brito Querido Jailson Fernando
Année de soutenance : 2017
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Structure and evolution of animal mitochondrial tRNAs
Résumé : Les approches bioinformatiques développées au cours de cette thèse ont permis d’une part le développement de banques de données concernant les ARNt classiques ainsi que les ARNt mitochondriaux de métazoaires. Celles-ci sont basées sur de nouveaux outils pour la détection de gènes d’ARNt «bizarres» ...
Mots clés : ARN de transfert, Métazoaires, Mitochondries, Bases de données d'acides nucléiques
Auteur : Jühling Frank
Année de soutenance : 2013
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Structure de l'ARN au sein des ribonucléoprotéines des Influenzavirus A
Résumé : Le génome des Influenzavirus A est constitué de huit segments d’ARN de polarité négative formant des ribonucléoprotéines virales (RNPv). La segmentation du génome complique l’empaquetage du génome, puisqu’un jeu complet de segments est nécessaire à l’infectiosité des virus. Il est aujourd’hui admis ...
Mots clés : Influenzavirus A, Nucléoprotéines, Molécules chaperonnes, Protéines virales, Interactions ARN-protéine
Auteur : Ferhadian Damien
Année de soutenance : 2018
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Study of mechanisms regulating the biogenesis of microRNAs expressed by Kaposi’s sarcoma-associated herpesvirus
Résumé : Les microARN (miARN) sont d’importants régulateurs de l’expression génique exprimés par presque tous les eucaryotes, ainsi que certains de leurs virus associés. Dans le cadre de ce projet, nous avons étudié la biogenèse d’un cluster de miARN exprimé par un oncovirus humain, l’Herpèsvirus associé ...
Mots clés : MicroARN, Herpes simplex virus, Régulation génétique
Auteur : Vilimova Monika
Année de soutenance : 2022
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Synthèse et caractérisations de nouvelles sondes fluorescentes et réactifs chimiques pour l'étude structurale de l'ARN
Résumé : L’étude de la structure de l’ARN est reconnue un sujet d’actualité qui permet de connaître sa fonction. Il existe différentes techniques enzymatiques ou chimiques classiques et récentes couplées au séquençage à haut débit pour étudier la structure de l’ARN. Le projet de thèse vise l’optimisation ...
Mots clés : ARN, Génomique, VIH (virus), Sondes fluorescentes, Chimie click
Auteur : Barhoum Patrick
Année de soutenance : 2013
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The mechanism of inhibition of cap-dependent translation by the Translation Inhibitory Elements (TIE) a3 and a11 in Hox mRNAs
Résumé : Chez les eucaryotes, les ARNm cellulaires subissent une traduction dépendante de la coiffe qui nécessite des facteurs appelés eIFs pour produire des protéines, mais les ARNm Hox sont traduits dans un mécanisme non canonique en raison de deux régulateurs d'ARN dans l'élément 5'UTR appelé Internal ...
Mots clés : ARN messagers, Transcription génétique, Inhibiteurs nucléotidiques de la transcriptase inverse, GTP, Gènes homéotiques
Auteur : Alghoul Fatima
Année de soutenance : 2019
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The mechanism of inhibition of cap-dependent translation by the Translation Inhibitory Elements (TIE) a3 and a11 in Hox mRNAs
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Thermodynamic study of protein synthesis and of antibiotics targeting the ribosome
Résumé : Le ribosome est une machine biomoléculaire primordiale pour la survie de tout organisme du fait de son rôle central au sein de la synthèse protéique. La caractérisation des interactions avec ses nombreux partenaires est un élément crucial pour mieux comprendre les mécanismes de la traduction et ...
Mots clés : Site d'entrée interne des ribosomes, Synthèse protéique, Traduction génétique, Résistance aux antibiotiques, Protéines ribosomiques
Auteur : Schenckbecher Emma
Année de soutenance : 2019
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Thermodynamic study of protein synthesis and of antibiotics targeting the ribosome
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Tissue-specific expression of the human Glycyl-tRNA synthetase : connection with the Charcot-Marie-Tooth disease
Résumé : La glycyl-ARNt synthétase humaine (GRS) est une enzyme clé dans la traduction des protéines dans le cytosol et la mitochondrie. Chez l’Homme, des mutations de la GRS conduisent à la neuropathie périphérique Charcot-Marie-Tooth (CMT). Bien que l’activité de la GRS soit ubiquitaire, les mutations ...
Mots clés : Maladie de Charcot-Marie-Tooth, Aminoacyl-ARNt synthétases, Transcription génétique, Neuropathies périphériques
Auteur : Alexandrova Jana
Année de soutenance : 2014
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Tissue-specific expression of the human Glycyl-tRNA synthetase : connection with the Charcot-Marie-Tooth disease
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