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Résumé : [...]Pour répondre à la nécessité d'un pipeline d'annotation d'ARNnc rapide et fiable dans le contexte des projets de séquençage génomique de grand envergure, tels que lesprojets Génolevures et Dikaryome, nous avons mis au point deux pipelines d'annotation automatique, intégrant des outils disponibles ...
Mots clés : ARN non codants, ARN, Modélisation tridimensionnelle, Bioinformatique
Auteur : Almeida Costa Da Cruz José António
Année de soutenance : 2011
Résumé : La protection antimicrobienne répond à une attente dans de nombreux domaines médicaux où la constitution d'un biofilm microbien à la surface de matériaux est redoutée. La constitution de ce biofilm se fait en trois temps bien définis: l'attachement, la colonisation et l'accroissement. Une fois le ...
Mots clés : Polyélectrolytes, Antibactériens, Odontostomatologie, Biofilms, Odontologie
Auteur : Etienne Olivier
Année de soutenance : 2004
Résumé : Les découvertes de ces dernières années suggèrent que la complexité et le degré d'évolution d'un organisme sont reliés à l'existence de centaines de milliers d'ARN non codants, de petites et de grandes tailles. Ainsi, de simple acteur dans les mécanismes de traduction (via les ARNm, ARNt et ARNr), ...
Mots clés : ARN, Modélisation tridimensionnelle, Bioinformatique
Auteur : Ludwig Thomas
Année de soutenance : 2008
Résumé : Mon projet s’est attaché à étudier différents aspects de la composition et de l’organisation de l’environnement tumoral. L’objectif de mon travail a été de comprendre comment la Ténascine-C (TNC) est organisée dans les cancers humains et dans des modèles de cancers murins, afin d’améliorer nos c ...
Mots clés : Néovascularisation, Matrice extracellulaire
Auteur : Gasser Isabelle
Année de soutenance : 2011
Résumé : Développement d'un nouveau principe d'ostéosynthèse des fractures épiphyso-métaphysaires de l'enfant.Les fractures épiphyso-métaphysaires chez l'enfant présentent un risque d'atteinte du cartilage de croissance. Celui-ci peut être lié au traumatisme lui-même mais aussi au traitement mis en œuvre ...
Mots clés : Ostéosynthèse, Fractures chez l'enfant, Épiphyses, Épiphyses (os), Enfant
Auteur : Gicquel Philippe
Année de soutenance : 2006
Résumé : L'identification des signaux RMN en terme d'acide aminé est connu sous le terme d'attribution. Cette étape est incontournable non seulement lorsque l'on veut déterminer la structure d'une protéine par RMN mais également lorsque l'on a une structure cristallographique et que l'on veut étudier plus ...
Mots clés : Résonance magnétique nucléaire, Protéines, Distribution spectrale de l'énergie
Auteur : Coutouly Marie-Aude
Année de soutenance : 2005
Résumé : Les travaux présentés dans cette thèse s'inscrivent dans le cadre de la génomique à haut-débit, et tout particulièrement l'analyse de séquences d'Expressed Sequence Tags (EST). Les efforts mis en oeuvre ont abouti à la réalisation d'une suite logicielle permettant de gérer une cascade de traitements ...
Mots clés : Bioinformatique, Polychètes, Analyse des données
Auteur : Gagnière Nicolas
Année de soutenance : 2009
Résumé : L'objectif majeur de ce travail était de développer des sondes site-actif dérivées d'inhibiteurs, comportant des modules chimiques fonctionnels biocompatibles de type photo-liaison, couplage par réaction bio-orthogonale, clivage chimique et module de purification par affinité pour des applications ...
Mots clés : Protéomique, Ligands (biochimie), Composés complexes, Azobenzène, ADN-gyrase, Inhibiteurs de l'ADN-gyrase
Auteur : Moune Dimala Martin
Année de soutenance : 2010
Résumé : Les protéines intrinsèquement désordonnées (IDP), pendant longtemps ignorées, s'avèrent d'un grand intérêt biologique. En effet, malgré leur manque de structure secondaire, ces protéines ont une activité et sont impliquées dans de nombreuses interactions protéine-protéine ou protéine-ligand, notamment ...
Mots clés : Séquence des acides aminés, Conformation des protéines, Résonance magnétique nucléaire, Interactions protéine-protéine
Auteur : Tanty Matthieu
Année de soutenance : 2011
Résumé : Les récepteurs couplés aux protéines G (RCPG) sont des protéines membranaires responsables de la transduction de signaux de l'extérieur vers l'intérieur de la cellule. Localisés partout dans l'organisme, ils sont impliqués dans de très nombreuses fonc tions physiologiques comme la vision, l'olfaction, ...
Mots clés : Protéines G, Bioinformatique, Sciences naturelles
Auteur : Surgand Jean-Sébastien
Année de soutenance : 2006
Résumé : L'étude des mécanismes de développement des thromboses et l'évaluation de l'efficacité de substances antithrombotiques nécessitent d'établir des modèles expérimentaux dans l'animal. L'obtention, ces dernières années, de souris génétiquement modifiées, permettant de manipuler et d'évaluer l'importance ...
Mots clés : Thrombose, Obstruction des artères, Sang, Lasers en médecine
Auteur : Nonne Christelle
Année de soutenance : 2007
Résumé : Le diagnostic des pathologies héréditaires rares devient de plus en plus difficile à cause de leur origine multigénique. Cette multigénicité est très bien illustrée par les ataxies autosomiques récessives. A ce jour 14 gènes responsables d'ataxies autosomiques récessives ainsi que plusieurs loci ...
Mots clés : Ataxie, Friedreich, Maladie de, Génétique moléculaire humaine, Génotype, Chromosomes humains
Auteur : H'Mida-Ben Brahim Dorra
Année de soutenance : 2009
Résumé : L'évolution a sélectionné des stratégies d'économie d'énergie afin de permettre aux espèces vivantes de survivre au sein des environnements fluctuants. Dans le contexte des changements globaux, la survie de nombreuses espèces dépendra des limites de plasticité de ces stratégies. Les petites espèces, ...
Mots clés : Microcèbe murin, Animaux
Auteur : Giroud Sylvain
Année de soutenance : 2008
Résumé : Les bactéries sont retrouvés dans des milieux très variés allant des plus communs aux plus extrêmes, comme les sites miniers arséniés de Carnoulès, de Salsigne ou de Sainte-Marie-aux-Mines. De nombreuses bactéries sont impliquées dans le cycle bio-géochimique de l'arsenic et jouent un rôle crucial ...
Mots clés : arsenic--oxydation, oxydoreduction, arsenites (chimie), bacteries
Auteur : Heinrich-Salmeron Audrey
Année de soutenance : 2009
Résumé : Les oiseaux marins sont présents sur toutes les mers du globe et dans des zones climatiques extrêmement différentes, allant des tropiques jusqu aux régions polaires. Un grand nombre d'espèces vivent en haute mer et capturent leurs proies sous l'eau. L'élément liquide possède un énorme pouvoir de ...
Mots clés : Phalacrocorax, Oiseaux de mer, Animaux -- Adaptation
Auteur : Enstipp Manfred
Année de soutenance : 2005
Résumé : Le cancer du rein est résistant aux thérapies existantes. Des acteurs intervenant dans l'homéostasie peuvent être réexprimés par des cellules cancéreuses. Nous avons recherché ici si la cancérogenèse et la progression tumorale font appel à des voies/marqueurs développementaux. Nos investigations ...
Mots clés : Rein, Marqueurs tumoraux, Facteurs de transcription, Oncogènes
Auteur : Dormoy Valérian
Année de soutenance : 2010
Résumé : La duplication des séquences d'ADN contribue à la plasticité des génomes et représente un des moteurs de l'évolution. Ces dernières années, le séquençage systématique de plusieurs organismes montre l'importance quantitative des régions dupliquées au sein des génomes. Cependant, l'analyse de ces ...
Mots clés : Saccharomyces cerevisiae, Génome, ADN, Aneuploïdie
Auteur : Schacherer Joseph
Année de soutenance : 2005
Résumé : De l'activité électrique spontanée est observée dans de nombreuses structures cérébrales. C'est pour explorer les mécanismes d'initiation et de persistance et le rôle de l'architecture fonctionnelle dans l'activité spontanée que nous avons mis au point une approche de culture où l'architecture des ...
Mots clés : Neurones, Réseaux neuronaux (physiologie), Neurostimulation, Patch-clamp, Technique du, Électrophysiologie
Auteur : Wyart Claire
Année de soutenance : 2003