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École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
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Development of evolutionary models for non-coding RNAs
Résumé
:
[...]Pour répondre à la nécessité d'un pipeline d'annotation d'ARNnc rapide et fiable dans le contexte des projets de séquençage génomique de grand envergure, tels que lesprojets Génolevures et Dikaryome, nous avons mis au point deux pipelines d'annotation automatique, intégrant des outils disponibles ...
Mots clés
:
ARN non codants, ARN, Modélisation tridimensionnelle, Bioinformatique
Auteur
:
Almeida Costa Da Cruz José António
Année de soutenance
:
2011
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Development of evolutionary models for non-coding RNAs
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Développement d'interfaces à propiétés antimicrobiennes par la fonctionnalisation de multicouches de polyélectrolytes
Résumé
:
La protection antimicrobienne répond à une attente dans de nombreux domaines médicaux où la constitution d'un biofilm microbien à la surface de matériaux est redoutée. La constitution de ce biofilm se fait en trois temps bien définis: l'attachement, la colonisation et l'accroissement. Une fois le ...
Mots clés
:
Polyélectrolytes, Antibactériens, Odontostomatologie, Biofilms, Odontologie
Auteur
:
Etienne Olivier
Année de soutenance
:
2004
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Développement d'interfaces à propiétés antimicrobiennes par la fonctionnalisation de multicouches de polyélectrolytes
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Développement d'un environnement bioinformatique dédié à la construction d'architectures d'ARN
Résumé
:
Les découvertes de ces dernières années suggèrent que la complexité et le degré d'évolution d'un organisme sont reliés à l'existence de centaines de milliers d'ARN non codants, de petites et de grandes tailles. Ainsi, de simple acteur dans les mécanismes de traduction (via les ARNm, ARNt et ARNr), ...
Mots clés
:
ARN, Modélisation tridimensionnelle, Bioinformatique
Auteur
:
Ludwig Thomas
Année de soutenance
:
2008
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Développement d'un environnement bioinformatique dédié à la construction d'architectures d'ARN
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Développement d'un modèle murin pour cibler et comprendre le rôle de la Ténascine-C dans la progression tumorale
Résumé
:
Mon projet s’est attaché à étudier différents aspects de la composition et de l’organisation de l’environnement tumoral. L’objectif de mon travail a été de comprendre comment la Ténascine-C (TNC) est organisée dans les cancers humains et dans des modèles de cancers murins, afin d’améliorer nos c ...
Mots clés
:
Néovascularisation, Matrice extracellulaire
Auteur
:
Gasser Isabelle
Année de soutenance
:
2011
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Développement d'un modèle murin pour cibler et comprendre le rôle de la Ténascine-C dans la progression tumorale
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Développement d'un nouveau principe d'ostéosynthèse des fractures épiphysométaphysaires de l'enfant
Résumé
:
Développement d'un nouveau principe d'ostéosynthèse des fractures épiphyso-métaphysaires de l'enfant.Les fractures épiphyso-métaphysaires chez l'enfant présentent un risque d'atteinte du cartilage de croissance. Celui-ci peut être lié au traumatisme lui-même mais aussi au traitement mis en œuvre ...
Mots clés
:
Ostéosynthèse, Fractures chez l'enfant, Épiphyses, Épiphyses (os), Enfant
Auteur
:
Gicquel Philippe
Année de soutenance
:
2006
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Développement d'un nouveau principe d'ostéosynthèse des fractures épiphysométaphysaires de l'enfant
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Développement d'une méthode d'interprétation rapide des spectres RMN pour les protéines
Résumé
:
L'identification des signaux RMN en terme d'acide aminé est connu sous le terme d'attribution. Cette étape est incontournable non seulement lorsque l'on veut déterminer la structure d'une protéine par RMN mais également lorsque l'on a une structure cristallographique et que l'on veut étudier plus ...
Mots clés
:
Résonance magnétique nucléaire, Protéines, Distribution spectrale de l'énergie
Auteur
:
Coutouly Marie-Aude
Année de soutenance
:
2005
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Développement d'une méthode d'interprétation rapide des spectres RMN pour les protéines
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Développement d'une suite logicielle pour l'analyse et l'annotation intégrative automatiques de transcrits et de protéines : application aux banques d'ADNc de l'annélide polychète Alvinella pompejana
Résumé
:
Les travaux présentés dans cette thèse s'inscrivent dans le cadre de la génomique à haut-débit, et tout particulièrement l'analyse de séquences d'Expressed Sequence Tags (EST). Les efforts mis en oeuvre ont abouti à la réalisation d'une suite logicielle permettant de gérer une cascade de traitements ...
Mots clés
:
Bioinformatique, Polychètes, Analyse des données
Auteur
:
Gagnière Nicolas
Année de soutenance
:
2009
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Développement d'une suite logicielle pour l'analyse et l'annotation intégrative automatiques de transcrits et de protéines : application aux banques d'ADNc de l'annélide polychète Alvinella pompejana
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Développement de ligands et d'outils chimiques pour la protéomique fonctionnelle
Résumé
:
L'objectif majeur de ce travail était de développer des sondes site-actif dérivées d'inhibiteurs, comportant des modules chimiques fonctionnels biocompatibles de type photo-liaison, couplage par réaction bio-orthogonale, clivage chimique et module de purification par affinité pour des applications ...
Mots clés
:
Protéomique, Ligands (biochimie), Composés complexes, Azobenzène, ADN-gyrase, Inhibiteurs de l'ADN-gyrase
Auteur
:
Moune Dimala Martin
Année de soutenance
:
2010
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Développement de ligands et d'outils chimiques pour la protéomique fonctionnelle
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Développement de nouveaux outils et approches pour l'étude des protéines intrinsèquement désordonnées
Résumé
:
Les protéines intrinsèquement désordonnées (IDP), pendant longtemps ignorées, s'avèrent d'un grand intérêt biologique. En effet, malgré leur manque de structure secondaire, ces protéines ont une activité et sont impliquées dans de nombreuses interactions protéine-protéine ou protéine-ligand, notamment ...
Mots clés
:
Séquence des acides aminés, Conformation des protéines, Résonance magnétique nucléaire, Interactions protéine-protéine
Auteur
:
Tanty Matthieu
Année de soutenance
:
2011
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Développement de nouveaux outils et approches pour l'étude des protéines intrinsèquement désordonnées
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Développement de nouvelles méthodes bioinformatiques pour l'étude des récepteurs couplés aux protéines G
Résumé
:
Les récepteurs couplés aux protéines G (RCPG) sont des protéines membranaires responsables de la transduction de signaux de l'extérieur vers l'intérieur de la cellule. Localisés partout dans l'organisme, ils sont impliqués dans de très nombreuses fonc tions physiologiques comme la vision, l'olfaction, ...
Mots clés
:
Protéines G, Bioinformatique, Sciences naturelles
Auteur
:
Surgand Jean-Sébastien
Année de soutenance
:
2006
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Développement de nouvelles méthodes bioinformatiques pour l'étude des récepteurs couplés aux protéines G
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Développement et caractérisation d'un modèle de thrombose artérielle mésentérique induite par un rayon laser et évaluation de nouvelles cibles antiplaquettaires
Résumé
:
L'étude des mécanismes de développement des thromboses et l'évaluation de l'efficacité de substances antithrombotiques nécessitent d'établir des modèles expérimentaux dans l'animal. L'obtention, ces dernières années, de souris génétiquement modifiées, permettant de manipuler et d'évaluer l'importance ...
Mots clés
:
Thrombose, Obstruction des artères, Sang, Lasers en médecine
Auteur
:
Nonne Christelle
Année de soutenance
:
2007
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Développement et caractérisation d'un modèle de thrombose artérielle mésentérique induite par un rayon laser et évaluation de nouvelles cibles antiplaquettaires
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Diagnostic moléculaire par cartographie par homozygotie des ataxies autosomiques récessives et recherche du gène impliqué dans une nouvelle forme d'ataxie récessive non progressive
Résumé
:
Le diagnostic des pathologies héréditaires rares devient de plus en plus difficile à cause de leur origine multigénique. Cette multigénicité est très bien illustrée par les ataxies autosomiques récessives. A ce jour 14 gènes responsables d'ataxies autosomiques récessives ainsi que plusieurs loci ...
Mots clés
:
Ataxie, Friedreich, Maladie de, Génétique moléculaire humaine, Génotype, Chromosomes humains
Auteur
:
H'Mida-Ben Brahim Dorra
Année de soutenance
:
2009
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Diagnostic moléculaire par cartographie par homozygotie des ataxies autosomiques récessives et recherche du gène impliqué dans une nouvelle forme d'ataxie récessive non progressive
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Différences saisonnières des mécanismes d'économie d'énergie d'un primate malgache hétérotherme : le microcèbe
Résumé
:
L'évolution a sélectionné des stratégies d'économie d'énergie afin de permettre aux espèces vivantes de survivre au sein des environnements fluctuants. Dans le contexte des changements globaux, la survie de nombreuses espèces dépendra des limites de plasticité de ces stratégies. Les petites espèces, ...
Mots clés
:
Microcèbe murin, Animaux
Auteur
:
Giroud Sylvain
Année de soutenance
:
2008
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Différences saisonnières des mécanismes d'économie d'énergie d'un primate malgache hétérotherme : le microcèbe
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Diversité des mécanismes d'oxydo-réduction de l'arsenic chez les bactéries : des souches cultivables aux communautés
Résumé
:
Les bactéries sont retrouvés dans des milieux très variés allant des plus communs aux plus extrêmes, comme les sites miniers arséniés de Carnoulès, de Salsigne ou de Sainte-Marie-aux-Mines. De nombreuses bactéries sont impliquées dans le cycle bio-géochimique de l'arsenic et jouent un rôle crucial ...
Mots clés
:
arsenic--oxydation, oxydoreduction, arsenites (chimie), bacteries
Auteur
:
Heinrich-Salmeron Audrey
Année de soutenance
:
2009
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Diversité des mécanismes d'oxydo-réduction de l'arsenic chez les bactéries : des souches cultivables aux communautés
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Diving energetics and fine scale foraging behaviour of avian divers and their capacity to buffer environmental change
Résumé
:
Les oiseaux marins sont présents sur toutes les mers du globe et dans des zones climatiques extrêmement différentes, allant des tropiques jusqu aux régions polaires. Un grand nombre d'espèces vivent en haute mer et capturent leurs proies sous l'eau. L'élément liquide possède un énorme pouvoir de ...
Mots clés
:
Phalacrocorax, Oiseaux de mer, Animaux -- Adaptation
Auteur
:
Enstipp Manfred
Année de soutenance
:
2005
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Diving energetics and fine scale foraging behaviour of avian divers and their capacity to buffer environmental change
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DmMyD88, un nouvel élément pour l'étude des récepteurs Toll de la drosophile
Résumé
:
Pas de résumé
Mots clés
:
Drosophiles, Réponse immunitaire
Auteur
:
Bilak Hana
Année de soutenance
:
2004
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DmMyD88, un nouvel élément pour l'étude des récepteurs Toll de la drosophile
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Dosage des analogues de l'insuline à l'aide de deux immunodosages de l'insuline humaine : évaluation analytique et application à l'étude de la biotransformation de la glargine
Résumé
:
Pas de résumé
Mots clés
:
Insuline, Insuline glargine, Immunodosage, Biotransformation (métabolisme)
Auteur
:
Agin Arnaud
Année de soutenance
:
2006
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Dosage des analogues de l'insuline à l'aide de deux immunodosages de l'insuline humaine : évaluation analytique et application à l'étude de la biotransformation de la glargine
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Du développement au cancer : implication des voies néphrogéniques dans la croissance du carcinome à cellules rénales humain
Résumé
:
Le cancer du rein est résistant aux thérapies existantes. Des acteurs intervenant dans l'homéostasie peuvent être réexprimés par des cellules cancéreuses. Nous avons recherché ici si la cancérogenèse et la progression tumorale font appel à des voies/marqueurs développementaux. Nos investigations ...
Mots clés
:
Rein, Marqueurs tumoraux, Facteurs de transcription, Oncogènes
Auteur
:
Dormoy Valérian
Année de soutenance
:
2010
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Du développement au cancer : implication des voies néphrogéniques dans la croissance du carcinome à cellules rénales humain
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Duplications dans le génome de Saccharomyces cerevisiae : sélections, caractérisation et mécanismes
Résumé
:
La duplication des séquences d'ADN contribue à la plasticité des génomes et représente un des moteurs de l'évolution. Ces dernières années, le séquençage systématique de plusieurs organismes montre l'importance quantitative des régions dupliquées au sein des génomes. Cependant, l'analyse de ces ...
Mots clés
:
Saccharomyces cerevisiae, Génome, ADN, Aneuploïdie
Auteur
:
Schacherer Joseph
Année de soutenance
:
2005
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Duplications dans le génome de Saccharomyces cerevisiae : sélections, caractérisation et mécanismes
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Dynamique de l'activité spontanée dans des réseaux de neurones hippocampiques d'architecture contôlée en culture
Résumé
:
De l'activité électrique spontanée est observée dans de nombreuses structures cérébrales. C'est pour explorer les mécanismes d'initiation et de persistance et le rôle de l'architecture fonctionnelle dans l'activité spontanée que nous avons mis au point une approche de culture où l'architecture des ...
Mots clés
:
Neurones, Réseaux neuronaux (physiologie), Neurostimulation, Patch-clamp, Technique du, Électrophysiologie
Auteur
:
Wyart Claire
Année de soutenance
:
2003
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Dynamique de l'activité spontanée dans des réseaux de neurones hippocampiques d'architecture contôlée en culture
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