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A novel, evolutionarily conserved transcription factor that regulates the inflammatory response
Description : La réponse immunitaire est un mécanisme ancestral des organismes vivants et les voies moléculaires contrôlant l'hématopoïèse sont conservées. Le facteur de transcription Gcm est exprimé et requis dans la glie et les hémocytes des mouches, les cellules charognards agissant à l'intérieur et à l'ex ...
Mots clés : Facteurs de transcription, Réponse immunitaire, Cellules gliales
Auteur : Pavlidaki Alexia
Année de soutenance : 2021
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A novel, evolutionarily conserved transcription factor that regulates the inflammatory response
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Accuracy of gene expression through understanding structural basis of a translation cycle on the eukaryotic ribosomes
Description : Le ribosome est un complexe macromoléculaire impliqué dans la synthèse protéique de toutes les cellules vivantes. L’étape d’élongation de cette synthèse est un processus itératif débutant par la sélection au sein du ribosome d’un ARNt aminoacylé suivie par le transfert du peptide du site P- vers ...
Mots clés : Translocation (génétique), Élongation (biologie moléculaire), Protéines -- Modifications posttraductionnelles, Radiocristallographie, Facteurs d'élongation transcriptionnelle
Auteur : Djumagulov Muminjon
Année de soutenance : 2018
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Accuracy of gene expression through understanding structural basis of a translation cycle on the eukaryotic ribosomes
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An NMR study of the effects of fluorinated prolines on proteins properties
Description : La proline est un acide aminé particulier qui peut adopter deux conformères non planaires ςγ endo et ςγ exo et qui peuple de manière significative l’isomère cis comparé à tous les autres acides aminés naturels. La conformation du cycle, les populations cis et trans ainsi que la cinétique ...
Mots clés : Proline, Stéréochimie, Fluor
Auteur : Ben Bouzayene Abir
Année de soutenance : 2023
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An NMR study of the effects of fluorinated prolines on proteins properties
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Analyse de la base transcriptionnelle de la transdifférenciation naturelle chez Caenorhabditis elegans
Description : Au cours de ce projet de doctorat, j'ai étudié un événement de transdifférenciation naturelle se produisant naturellement in vivo dans une seule cellule en utilisant le ver nématode Caenorhabditis elegans comme organisme modèle. Cette cellule, appelée Y, se différencie d'une identité rectale en ...
Mots clés : Caenorhabditis elegans, Différenciation cellulaire, Génie génétique, Facteurs de transcription
Auteur : Osuna Luque Jaime
Année de soutenance : 2020
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Analyse de la base transcriptionnelle de la transdifférenciation naturelle chez Caenorhabditis elegans
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Analyse de la composition et de la fonction de la machinerie basale de transcription au cours du développement et de la différenciation
Description : TFIID et SAGA sont deux complexes importants pour la transcription, contenant la sous-unité TAF10. Nous avons analysé leur composition dans l’embryon murin et différents contextes cellulaires par immuno-précipitation et spectrométrie de masse. Les sous unités des complexes TFIID et SAGA ont été ...
Mots clés : Transcription génétique, Cellules souches embryonnaires, Murins, Facteur de transcription TFIID
Auteur : Bardot Paul Louis Bernard
Année de soutenance : 2018
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Analyse de la composition et de la fonction de la machinerie basale de transcription au cours du développement et de la différenciation
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Analyse des mécanismes assurant la robustesse d’un événement de transdifférenciation : rôle de l’ubiquitine ligase E3 SEL-10
Description : Les cellules différenciées peuvent changer de destin cellulaire de manière induite ou naturelle. Afin de comprendre et connaître les acteurs et mécanismes contrôlant les processus de reprogrammation, notre laboratoire étudie le changement d'identité (ou transdifférenciation, Td) naturel d’une cellule ...
Mots clés : Reprogrammation cellulaire, Épigénétique, Protéines F-box, Ubiquitin-protein ligases
Auteur : Delance Cécile
Année de soutenance : 2018
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Analyse des mécanismes assurant la robustesse d’un événement de transdifférenciation : rôle de l’ubiquitine ligase E3 SEL-10
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Analyse des mécanismes moléculaires et cellulaires conduisant à une inflammation dans l'intestin et une progression tumorale induits par la perte de la sous-unité d'intégrine Alpha6 chez la souris
Description : Le laboratoire a établi un modèle de souris α6ΔIEC qui développe une inflammation chronique intestinale associée à la formation d’adénocarcinomes colorectaux. Ce modèle correspond à une délétion ciblée à l’épithélium intestinal de l’intégrine α6β4. Mon projet de thèse a consisté à définir les mé ...
Mots clés : Maladies inflammatoires chroniques de l'intestin, Intégrines, Cancer colorectal, Médiateurs de l'inflammation, Souris de laboratoire, Inflammasomes
Auteur : Hamade Hussein
Année de soutenance : 2014
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Analyse des mécanismes moléculaires et cellulaires conduisant à une inflammation dans l'intestin et une progression tumorale induits par la perte de la sous-unité d'intégrine Alpha6 chez la souris
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Analyse du rôle du facteur de transcription Ikaros dans le développement des cellules dendritiques plasmacytoïdes
Description : Le développement et la fonction des cellules dendritiques plasmacytoïdes (pDCs) doivent être finement régulés afin d’éviter le développement de maladies auto-immunes ou de leucémies. Il a été montré récemment qu’une fraction des leucémies humaines dérivées des pDCs possède des mutations de type ...
Mots clés : Cellules dendritiques, Facteurs de transcription, Immunophénomarquage, Transduction du signal cellulaire, Récepteurs Notch
Auteur : Mastio Jérôme
Année de soutenance : 2013
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Analyse du rôle du facteur de transcription Ikaros dans le développement des cellules dendritiques plasmacytoïdes
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Analyse du rôle du facteur de transcription Ikaros dans le développement des lymphocytes TH17
Description : Les cellules T auxiliaires TH17 sont caractérisées par l’expression de la cytokine IL-17A, ainsi que le facteur de transcription RORɣt. Elles sont connues pour jouer un rôle clé dans la pathogenèse de la sclérose en plaques. Ces cellules existent sous deux formes : les cellules régulatrices, imm ...
Mots clés : Lymphocytes T, Transcription génétique, Facteur de transcription Ikaros, Membre-3 du groupe F de la sous-famille-1 de récepteurs nucléaires
Auteur : Maurer Gaëtan
Année de soutenance : 2017
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Analyse du rôle du facteur de transcription Ikaros dans le développement des lymphocytes TH17
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Analyse structurale et interactomique des ubiquitine-ligases E3, Ube3A et HERC2, impliquées dans le syndrome d'Angelman
Description : Le syndrome d'Angelman ainsi que le syndrome du spectre autistique Dup15q sont causés par des dérégulations d'origine génétique de l'expression ou de l'activité de la protéine "E3 ubiquitine-ligase" Ube3a (E6AP). Ube3a lie et est modulée par une autre E3 biquitine-ligase, HERC2, elle-même mutée ...
Mots clés : Angelman, Syndrome d', Ubiquitine, Interactions protéine-protéine
Auteur : Demenge Auguste
Année de soutenance : 2023
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Analyse structurale et interactomique des ubiquitine-ligases E3, Ube3A et HERC2, impliquées dans le syndrome d'Angelman
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Analyses à multiniveaux de la signalisation du récepteur à l’acide rétinoïque beta (RARβ) pour comprendre et traiter des troubles neurologiques rares et progressifs
Description : Ma thèse s’est axée sur la compréhension du rôle de l’acide rétinoïque (AR) et de son récepteur RARβ dans le maintien des fonctions du striatum, une structure cérébrale centrale dans un certain nombre de troubles neurodégénératifs. Nous avons identifié un rôle de RARβ dans la neuroprotection des ...
Mots clés : Trétinoïne, Neuroprotecteurs, Maladies neurologiques
Auteur : Zinter Nicolas
Année de soutenance : 2023
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Analyses à multiniveaux de la signalisation du récepteur à l’acide rétinoïque beta (RARβ) pour comprendre et traiter des troubles neurologiques rares et progressifs
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Analyses structure fonction du module de déubiquitination du complexe SAGA
Description : Pour faciliter l’initiation de la transcription par l’ARN Polymérase II, le complexe co-activateur de la transcription SAGA possède une activité d’acétylation des histones H3 et une activité de déubiquitination des histones H2B, catalysée chez l’homme par l’enzyme USP22. Mon travail de thèse a porté ...
Mots clés : Ubiquitine, Transcription génétique, Chromatine, Histones
Auteur : Bonnet Jacques
Année de soutenance : 2012
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Analyses structure fonction du module de déubiquitination du complexe SAGA
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Analysis of the composition and the function of oocyte-specific TBP2-containing transcription machinery during mouse oogenesis
Description : La synthèse d’ARN au cours de la différenciation des ovocytes est essentielle à la fécondation et à l'initiation du développement précoce. La nature de la machinerie basale de transcription pendant la croissance ovocytaire n'est pas connue mais la protéine TBP est remplacée par une protéine semblable ...
Mots clés : Ovogenèse, Transcription génétique, Facteur de transcription TFIID, Protéine B de liaison à la transferrine, Facteur de transcription TFIIA
Auteur : Yu Changwei
Année de soutenance : 2018
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Analysis of the composition and the function of oocyte-specific TBP2-containing transcription machinery during mouse oogenesis
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Analysis of the core mechanisms underlying transdifferentiation in C. elegans
Description : L’objectif de cette étude est de définir quels facteurs centraux et spécifiques à l'événement affectent différents événements de transdifférenciation naturelle (Td) chez C. elegans. Nous nous sommes concentrés sur K-to-DVB (principalement), Y-to-PDA chez les mâles et G1-to-RMH (tous épithélial-à- ...
Mots clés : Caenorhabditis elegans, Facteurs de transcription, Voie de signalisation Wnt
Auteur : Riva Claudia
Année de soutenance : 2020
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Analysis of the core mechanisms underlying transdifferentiation in C. elegans
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Analysis of transcription factor and histone modification dynamics in the nucleus of single living cells using a novel antibody-based imaging approach
Description : Dans les cellules des eucaryotes, la transcription des gènes est contrôlée par une pléthore de complexes protéiniques. Cependant, la plupart de nos connaissances fondamentales sur la régulation de la transcription viennent des expériences biochimiques ou des expériences d’immunofluorescences utilisant ...
Mots clés : Transcription génétique, ARN polymérase II, Histones, Protéines -- Modifications posttraductionnelles, Cancer, Maturation post-traductionnelle des protéines
Auteur : Conic Sascha
Année de soutenance : 2018
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Analysis of transcription factor and histone modification dynamics in the nucleus of single living cells using a novel antibody-based imaging approach
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Apport des modèles murins à la compréhension des maladies associées à des variations du nombre de copies : monosomie 21 partielle et délétions et duplications des régions 16p11.2 et 17q21.31
Description : Les variations du nombre de copies (CNVs) incluent les délétions et les duplications de régions chromosomiques d’une taille variant de 50 pb à plusieurs Mb. Depuis 2005, les études d’association pangénomiques (GWAS) ont permis d’associer certains larges CNVs à des maladies syndromiques associées ...
Mots clés : Troubles de l'apprentissage, Troubles de la mémoire, Syndrome de Di George, Thérapie génique, Murins
Auteur : Arbogast Thomas
Année de soutenance : 2014
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Apport des modèles murins à la compréhension des maladies associées à des variations du nombre de copies : monosomie 21 partielle et délétions et duplications des régions 16p11.2 et 17q21.31
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Approches cliniques, précliniques et translationnelles des anomalies bucco-dentaires associées aux maladies rares
Description : Les anomalies bucco-dentaires et crânio-faciales sont des manifestations phénotypiques des maladies rares. Ce doctorat combine les approches cliniques, précliniques et translationnelles en particulier par l’étude des modèles murins génétiquement modifiés reproduisant les maladies rares étudiées. ...
Mots clés : Maladies rares, Bouche -- Maladies, Odontogenèse imparfaite, Phénotype, Animaux de laboratoire
Auteur : Morkmued Supawich
Année de soutenance : 2017
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Approches cliniques, précliniques et translationnelles des anomalies bucco-dentaires associées aux maladies rares
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Approches génétiques et thérapeutiques visant à comprendre et atténuer les conséquences de la délétion et duplication de la région 16p11.2 dans des modèles précliniques
Description : Les variations du nombre de copies (CNVs) des régions chromosomiques sont une source importante de variabilité chez l’humain. Ainsi certaines altérations structurelles ont été associées à des maladies syndromiques comme les CNVs de la région 16p11.2. Les réarrangements de cette région représentent ...
Mots clés : Autisme, Variabilité génétique, Phénotype, Développement neurologique
Auteur : Martin Lorenzo Sandra
Année de soutenance : 2019
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Approches génétiques et thérapeutiques visant à comprendre et atténuer les conséquences de la délétion et duplication de la région 16p11.2 dans des modèles précliniques
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Approches thérapeutiques pour le traitement de la myopathie myotubulaire
Description : La myopathie myotubulaire (XLMTM, OMIM 310400) est causée par des mutations dans le gêne MTM1 situé sur le chromosome X et apparaît à une fréquence de 1/50 000 naissances mâles. Les patients présentent une hypotonie et une faiblesse musculaire généralisées et de graves problèmes respiratoires à ...
Mots clés : Maladies musculaires, Expression génique, Phosphatases, Myopathies congénitales structurales
Auteur : Jamet Thibaud
Année de soutenance : 2012
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Approches thérapeutiques pour le traitement de la myopathie myotubulaire
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ARN non-codants et protéines effecteurs de la biologie du cil : identification du microARN let-7b comme modulateur de la ciliogenèse et rôle ciliaire putatif de l'Ataxine-7 dans l'ataxie spinocérébelleuse 7
Description : Le cil est une organelle conservée au fil de l’évolution qui se projette de presque toutes les cellules de vertébrés. Des mutations dans les gènes codant pour des protéines impliquées dans la structure ou la fonction des cils peuvent causer différentes anomalies développementales ou dégénératives, ...
Mots clés : Cils (cytologie), MicroARN, Génie génétique, Ciliopathies, Ataxies spinocérébelleuses
Auteur : Fievet Lorraine
Année de soutenance : 2019
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ARN non-codants et protéines effecteurs de la biologie du cil : identification du microARN let-7b comme modulateur de la ciliogenèse et rôle ciliaire putatif de l'Ataxine-7 dans l'ataxie spinocérébelleuse 7
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Assessing the links between enhancer-promoter proximity, local chromatin dynamics and gene activity
Description : Le lien entre la dynamique de la chromatine et la transcription reste flou, notamment parce que très peu de loci ont été évalués. Dans cette étude, en utilisant le locus autour du gène de la pluripotence Sox2 comme modèle, j'ai réalisé un double marquage pour suivre la communication et la mobilité ...
Mots clés : Promoteurs (génétique), Facteurs de transcription, Chromatine
Auteur : Platania Angeliki
Année de soutenance : 2021
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Assessing the links between enhancer-promoter proximity, local chromatin dynamics and gene activity
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Ataxies cérébelleuses héréditaires : identification de gènes responsables, description clinique et stratégie diagnostique
Description : Les ataxies cérébelleuses héréditaires sont des pathologies neuro-dégénératives rares, hétérogènes, complexes affectant le cervelet et parfois la moelle épinière et/ou les nerfs périphériques. Elles se transmettent sur le mode autosomique récessif (ARCA), dominant (SCA) ou lié à l’X. Les objectifs ...
Mots clés : Friedreich, Maladie de, Phénotype
Auteur : Renaud Mathilde
Année de soutenance : 2017
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Ataxies cérébelleuses héréditaires : identification de gènes responsables, description clinique et stratégie diagnostique
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Biochemical and structural characterization of Selenoprotein N and study of his dysfunction in pancreatic tissue
Description : Chez l'homme, des mutations dans le gène SELENON, codant pour la sélénoprotéine N (SelenoN), provoquent un groupe de maladies musculaires héréditaires appelés myopathies liées à SELENON. Les mécanismes pathologiques à l'origine de ces myopathies sont mal compris, car la fonction catalytique de SelenoN ...
Mots clés : Maladies musculaires, Sélénoprotéines, Stress du réticulum endoplasmique
Auteur : Rida Ahmad
Année de soutenance : 2023
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Biochemical and structural characterization of Selenoprotein N and study of his dysfunction in pancreatic tissue
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Biochemical, biophysical and structural study of proteins associated to human diseases : tcDAC2 and ADAT complex
Description : Au cours de ma thèse, j'ai étudié deux protéines associées aux maladies humaines : tcDAC2 et le complexe ADAT.TcDAC2 est une histone désacétylase du parasite Typanosoma cruzi qui cause la maladie de Chagas. TcDAC2 est essentiel pour la viabilité de T. cruzi et représente donc une cible potentielle ...
Mots clés : Histone désacétylase, Adénosine, Parasitoses
Auteur : Ramos Morales Elizabeth
Année de soutenance : 2021
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Biochemical, biophysical and structural study of proteins associated to human diseases : tcDAC2 and ADAT complex
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Biomécanique de l'élongation de l'axe antéro-postérieur chez l'embryon de poulet
Description : Chez les Vertébrés, le plan d’organisation du corps est mis en place lors de l’élongation de l’axe antéro-postérieur. L’importance du mésoderme pré-somitique (PSM) dans l’élongation a précédemment été démontrée chez l’embryon de poulet. Il a été proposé qu’un gradient de motilité cellulaire aléatoire, ...
Mots clés : Biologie du développement, Mésoderme, Élongation (biologie moléculaire), Viscoélasticité, Biomécanique
Auteur : Michaut Arthur
Année de soutenance : 2018
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Biomécanique de l'élongation de l'axe antéro-postérieur chez l'embryon de poulet
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Brisures de symétrie et directionnalité dans les systèmes vivants
Description : La manière dont les cellules suivent un mouvement dirigé sur de longues distances constitue une question fondamentale en Biologie. Ces migrations, individuelles ou collectives, émergent spontanément. Dans ce travail de thèse aux Interfaces entre la Physique et la Biologie, nous avons étudié les ...
Mots clés : Biophysique, Symétrie brisée (physique), Cellules -- Adhésivité, Polarité (biologie)
Auteur : Lo Vecchio Simon
Année de soutenance : 2020
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Brisures de symétrie et directionnalité dans les systèmes vivants
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Brn2 et Zic1 spécifient l'identité neuronale des cellules souches embryonnaires murines lors de la différenciation induite par l'acide rétinoïque
Description : Les cellules souches embryonnaires (ES) murines peuvent être différenciées in vitro en une population homogène de neurones glutamatergiques semblables aux neurones présents dans le cortex in vivo, suite à un traitement par l’acide rétinoïque (AR). Bien que le rôle de l’AR soit bien étudié, les f ...
Mots clés : Cellules souches embryonnaires, Cellules souches neurales, Facteurs de transcription, Génomique comparative, Trétinoïne
Auteur : Urban Sylvia
Année de soutenance : 2014
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Brn2 et Zic1 spécifient l'identité neuronale des cellules souches embryonnaires murines lors de la différenciation induite par l'acide rétinoïque
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CaMK1D controls β-cell mass and glucose homeostasis
Description : Le diabètes mellites de type 2 (T2DM) est caractérisé par une hyperglycémie provenant d’une dérégulation de la sécrétion d’insuline combinée avec une altération de l’action de l’insuline. CaMK1D est un nouveau gène identifié, dont le rôle reste à explorer. Dans l’étude exposée ici, j’ai montré que ...
Mots clés : Diabète non-insulinodépendant, Cellules bêta, Insulinorésistance, Troubles du métabolisme des lipides, Transcription génétique
Auteur : Mészáros Gergő
Année de soutenance : 2015
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CaMK1D controls β-cell mass and glucose homeostasis
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Caractérisation d'un modèle murin knock out pour le gène C9orf72
Description : Une expansion de répétitions G4C2 dans le gène C9ORF72 est la cause génétique la plus commune de la sclérose latérale amyotrophique (SLA). Afin d’étudier les conséquences de la perte d’expression de C9ORF72, nous avons généré un modèle murin knockout pour ce gène. Ces souris ne développent pas d ...
Mots clés : Sclérose latérale amyotrophique, Maladies neurodégénératives, Cellules dendritiques, Phénotype, Modèles animaux
Auteur : Corbier Camille
Année de soutenance : 2019
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Caractérisation d'un modèle murin knock out pour le gène C9orf72
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Caractérisation de l'entrée en sénescence en utilisant les mutants de longévité et l'intervention concernant les facteurs de vieillissement ERC et ROS
Description : [...] Pour étudier le processus de vieillissement chez la levure, j'utilise le système microfluidique pour capturer la levure mère unique et suivre ses divisions successives sous microscope time-lapse. En surveillant la dynamique des mécanismes moléculaires et l'évolution phénotypique à l'aide de ...
Mots clés : Saccharomyces cerevisiae, Génomique, Mutagenèse, Stress oxydatif
Auteur : Song Jia
Année de soutenance : 2020
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Caractérisation de l'entrée en sénescence en utilisant les mutants de longévité et l'intervention concernant les facteurs de vieillissement ERC et ROS
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